学术速运|LEGO-CSM:一种用于蛋白质功能表征的工具

题目:LEGO-CSM: a tool for functional characterisation of  proteins

文献来源:Bioinformatics

代码:https://biosig.lab.uq.edu.au/lego_csm

简介:随着测序技术的发展,新蛋白质的发现大大超过了人类实验表征蛋白质功能的能力和资源。LEGOCSM是一个全面的基于web的方式,通过利用成熟的和健壮的基于图的标签来监督学习模型,使用蛋白质序列和结构信息,以亚细胞定位、酶委员会(EC)数字和基因本体(GO)等形式的对蛋白质功能建模。本文展示了作者的模型的表现与其他方法一样好或更好,在亚细胞定位中,受试者工作特征曲线下面积(ROC AUC)高达0.93,EC高达0.93,在独立盲测中,GO项高达0.81。

主要内容:

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