学术速运|一个评估网络协议的积极统计基准

题目：A positive statistical benchmark to assess network agreement

文献来源:Nature Communications | (2023) 14:2988

代码：https://github.com/hbj153/normlap

简介：目前用于验证实验网络数据集的计算方法使用负基准与参考网络进行重叠。然而，这并不能量化这两个网络之间的一致性水平。为了解决这个问题，本文提出了一个积极的统计基准来确定网络之间的最大可能的重叠。该方法可以在最大熵框架中有效地生成这个基准，并提供了一种方法来评估观察到的重叠是否与最佳情况有显著不同。作者引入了一个归一化的重叠分数，标准化，以增强实验网络之间的比较。本文比较了分子和功能网络，形成一个一致的网络的人类和酵母网络数据集。Normlap评分可以通过提供一种替代网络阈值化和验证的计算替代方法来改善实验网络之间的比较。

主要内容：

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