Tensormol是由Yao[1]等人开发的神经网络化学势,一部分基于ANI1,可以通过对模型化学进行学习来拟合势能面,并将其模型作为MD力场进行使用。
此模型开发不完全,大量功能尚未实装,但由于其可以对电荷进行拟合,故具有一定的实用性。
Linux下安装教程:
Git链接:https://github.com/jparkhill/TensorMol
此模型使用了Tensorflow框架,考虑到服务器环境,本篇文章在Anaconda存在的环境下进行安装。
首先利用Anaconda新建环境(尽量选则清华源):
conda create -n tensormol python=3.6 # 使用python3.6防止TF报错
conda activate tensormol # 激活环境 如果报错 将conda 换位 source
安装CUDA、cudnn以及Tensorflow(重点步骤),CUDA版本选用8.0,cudnn版本选用:
conda install cudatoolkit=8.0 # 非常古老的版本
conda install