dgl.from_networkx()报错

原创已于 2022-04-20 19:19:47 修改 · 2.6k 阅读

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#深度学习

于 2022-03-13 15:28:58 首次发布

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跑代码报错

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博客讲述了在使用 DGL 库时遇到的一个常见错误，即尝试通过 `DGLGraph.from_networkx` 方法从 networkx 图转换为 DGL 图，但该方法已废弃。作者指出问题在于不应该先创建一个 DGLGraph 实例再调用 `from_networkx`，而应该直接使用 `dgl.from_networkx` 函数创建新图。此错误导致作者浪费了大量时间，建议在遇到此类问题时要考虑到其他可能的错误源，并提供了降级 DGL 版本为 0.4.3 作为备用解决方案。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

raise DGLError('DGLGraph.from_networkx is deprecated. Please call the following\n\n'
dgl._ffi.base.DGLError: DGLGraph.from_networkx is deprecated. Please call the following

dgl.from_networkx(nx_graph, node_attrs, edge_attrs)

, which creates a new DGLGraph from the networkx graph.

问题代码在这行。

 g_dgl = dgl.DGLGraph(multigraph=True).from_networkx(g_nx, node_attrs = None, edge_attrs = 'type')

本来代码是这样的（上下面这两段代码报错都是这个）

g_dgl = dgl.DGLGraph(multigraph=True)
g_dgl.from_networkx(g_nx, edge_attrs=['type'])

#################################################################
    # DEPRECATED: from the old DGLGraph
    #################################################################

    def from_networkx(self, nx_graph, node_attrs=None, edge_attrs=None):
        """DEPRECATED: please use

            ``dgl.from_networkx(nx_graph, node_attrs, edge_attrs)``

        which will return a new graph created from the networkx graph.
        """
        raise DGLError('DGLGraph.from_networkx is deprecated. Please call the following\n\n'
                       '\t dgl.from_networkx(nx_graph, node_attrs, edge_attrs)\n\n'
                       ', which creates a new DGLGraph from the networkx graph.')

一开始看到这个报错把注意力集中到node_attrs=None变成node_attrs上了，以为是必须要带参数的原因。

由于dgl知识并不熟悉，而且这是复现的SumGNN模型，对其中的逻辑只看懂了大概

于是回头学习dgl官方文档，代码在服务器上不知道怎么调试，从头开始把代码读了一遍，也没感觉到这样写有什么不对。很懵，前后看了两三天也不知道问题出在哪里，然后和师兄讨论，问了同学，可能是版本的问题，但是我降了版本发现也是一样的问题，后来同学发现是dgl.from_networkx这个要用dgl直接调用，

重点是dgl直接调用，

而前面的是先创建一个dgl图，用这个dgl图再来调用，如下所示，这就是不对的，这就是用g_dgl调用的，应该直接dgl.from_xxx，有很多同学来找我问这个问题，请看清楚先哦

另外如果是为了复现SUMGNN的话，可以直接将版本降到0.4.3，就没有这个报错了。

g_dgl = dgl.DGLGraph(multigraph=True)
    g_dgl.from_networkx(g_nx, edge_attrs=['type'])

希望以后遇到这类问题的时候一定不能陷入思维误区，多想一想其他的出现错误的可能。哪怕对背景知识不了解也没关系

这个错耽误太多时间了。。。