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原创 【从零开始的生信技能树-1】 R语言基础 -数据类型和结构
本文介绍了R语言中的数据类型判断、变量定义与赋值、常用数据结构操作。主要内容包括:1)使用class()函数判断数值型、字符型和逻辑型数据;2)变量命名规则(区分大小写,不能以数字开头)和三种赋值方式(推荐使用<-);3)向量、矩阵、数据框的创建与基本操作(数学运算、统计函数、子集提取等);4)数据类型转换函数is.和as.系列;5)列表与向量的区别(列表支持异构数据和嵌套结构)。文中提供了大量代码示例,适合R语言初学者快速掌握基础语法和数据结构操作。
2025-09-10 18:57:50
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原创 【从零开始的生信技能树-0】 R包的准备
本文介绍了Windows系统下R语言和R Studio的安装过程,以及常用生物信息学分析包的配置方法。首先详细说明了R 4.5.0和R Studio的安装步骤,然后重点讲解了如何设置国内镜像源(西湖大学/清华镜像)来提高下载速度。文章提供了核心生物信息学分析包的安装代码,包括GSEABase、GSVA、limma等常用工具包,并总结了不同安装命令(BiocManager::install与install.packages)的区别。最后给出了验证包安装成功的检查方法,并附上了安装过程中常见问题(如中文乱码)的
2025-08-18 15:59:29
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原创 【软件使用】CharmGUI添加POPC膜
旨在提供基于 Web 的图形用户界面来生成各种输入文件和分子系统,以促进和标准化 CHARMM 中常见和高级模拟技术的使用。Web环境提供了一个以交互方式构建和验证分子模型系统的理想平台,如果在某个步骤检查发现问题之后可以及时返回到之前的设置并再次重新生成整个系统。
2023-10-09 16:05:36
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空空如也
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