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原创 ITK-snap勾画结构生成的mask文件使用binvox和viewvox转化成体素化文件
在放射治疗中使用人体模型进行蒙特卡洛剂量模拟计算中,通常要将勾画在CT图像上勾画好的结构生成mask文件,这里就需要将mask文件进行重建并形成体素化的文件,用于射线在不同组织内的剂量计算。首先在ITK-snap对感兴趣区域进行勾画,这里危机器官和骨组织可以用阈值分割和自动勾画,肿瘤最好是医生根据自身经验手动勾画,将勾画好的结构分别命名并导出为mesh文件。
2024-10-16 10:42:04
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原创 pytorch|找不到 fbgemm.dll 问题处理
缺少libomp140.x86_64.dll。解决方法:在https://www.dllme.com/dll/files/libomp140_x86_64#google_vignette 下载某一个版本的dll文件,放到C:\Windows\System32中。
2024-08-30 11:04:31
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原创 shap库进行特征重要性排名。
最近把之前没写完的一篇文章拿出来重新改,里面一张柱状图真是显得很low,于是在浏览博客时发现了一张很惊艳的图瞬间觉得柱状图low爆了,于是各种找方法,终于找到了shap库,pip install shap安排上导入库anaconda search -t shappip install --channel 链接下载完成import numpy as npimport pandas as pdfrom sklearn.model_selection import train_test_spl
2022-03-24 19:33:44
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原创 使用SMOTE算法无法出现n_sample should >=n_neighbors错误。
引入somte模块进行过采样,可能是异常样本过少(1:50)只有5个,比smote算法中默认近邻个数少,需进行手动修改参数k_neighbors。原代码oversampler=SMOTE(random_state=0)修改后oversampler=SMOTE(ratio='auto',random_state=0,k_neighbors=2,m_neighbors=10,out_step=...
2018-12-26 17:47:43
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原创 ‘int’ has no attribute to object ‘ix’错误
‘int’ has no attribute to object ‘ix’错误from sklearn.model_selection import train_test_splitx = data.ix[:, data.columns != ‘EGFR’]y = data.ix[:, data.columns == ‘EGFR’]报错‘int’ has no attribute to o...
2018-12-26 16:37:15
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空空如也
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