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RSS订阅原创 变异检测：vcf文件合并
vcf文件储存的是样本的变异信息文件，在同一批次分析中，如果不是采用joint calling的方式进行分析，最终会获得单个样本的变异数据。这种文件很难对同组不同样本进行差异SNP分析，此处就需要对文件进行合并。vcf文件的合并有很多的软件可以做，主要的就是GATK、vcftools和bcftools三种，但是具体的合并方法需要根据不同vcf文件中的信息来判断。1. 样本相同、位点独立的vcf文件合并样本相同、位点独立指的是在不同文件中包含的样本一致，但是位点批次质检没有交集，分染色体call变异的结果
2020-08-05 13:24:50
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空空如也
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