weixin_40739969的博客

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R读取gmt文件的五种方式kegg_geneset1 <- qusage::read.gmt("c2.cp.kegg.v7.0.symbols.gmt") #返回的是listkegg_geneset2 <- clusterProfiler::read.gmt("c2.cp.kegg.v7.0.symbols.gmt") #返回的是表格kegg_geneset3 <- GSA::GSA.read.gmt("c2.cp.kegg.v7.0.symbols.gmt") #"GSA.gene

参考资料：Linux上Java的安装与配置在Linux系统中安装Neo4j-Neo4j在linux环境下的安装-远程访问neo4jStep1: 安装JAVA1.下载 JDK进入 Oracle 官方网站 下载合适的 JDK 版本，准备安装。注意：这里需要下载 Linux 版本。这里以jdk-8u151-linux-x64.tar.gz为例，你下载的文件可能不是这个版本，这没关系，...

GPL对应的Bioconductor注释包(最全)这个是我自己通过代码查找到的GPL对应的bioconductor的注释包，如果是能够找到的话，那么就是这个GPL平台号有应的注释包，如果在这里没有找到的话，那就应该是没有的咯。一个比较简单实用的方法，在这个网页下，直接快捷键 Ctrl + F, 然后输入你的平台号，就可以快速找到你要的注释包名称了。至于我如何得到的这个列表，看最底下的代码。...

基因富集分析（Gene Set Enrichment Analysis，GSEA）是一种针对全基因组表达谱芯片数据的分析方法，将基因与预定义的基因集进行比较。即综合现有的对基因的定位、性质、功能、生物学意义等信息基础，构建一个分子标签数据库，在此数据库中将已知基因按照染色体位置、已建立基因集、模序、肿瘤相关基因集和GO基因集等多个功能基因集进行分组与归类。通过分析基因表达谱数据，了解它们在特定的功...