r及rstudio安装ggvegan问题

一、问题描述

ggvegan是内置ggplot工具，用于更加美观展示vegan分析结果的可视化工具。目前只发布在github上。

使用作者推荐的remote方法和下载zip文件都不能成功安装。

主要报错：

Downloading GitHub repo gavinsimpson/ggvegan@HEAD
Error in utils::download.file(url, path, method = method, quiet = quiet,  : 
  无法打开URL'https://api.github.com/repos/gavinsimpson/ggvegan/tarball/HEAD'

Warning in install.packages :
  无法打开压缩文件'ggvegan/DESCRIPTION'，可能是因为'No such file or directory'

二、解决方法

参考一位外国小哥的做法：

remove.packages(c("curl","httr"))

install.packages(c("curl", "httr"))

Sys.setenv(CURL_CA_BUNDLE="/usr/lib64/microsoft-r/3.4/lib64/R/lib/microsoft-r-cacert.pem")

# install.packages('devtools')

devtools::install_git("https://github.com/gavinsimpso/ggvegan")

# 最后一步若报错，多试几遍

最后成功安装，library(ggvegan)。

PS：该方法解决的机理外国小哥也不清楚，如果有大神知道烦请分享一下，先谢过！