CP2K9.1安装-CPU版本

本文介绍了如何在Linux环境下安装CP2K9.1的CPU版本,包括从官网下载源码、解压、配置编译器、安装Intel MKL数学库、执行编译脚本、进行测试以及解决可能出现的错误。安装过程中强调了检查GCC、G++和GFortran版本,使用Intel MKL库,并在编译时可能出现的ELPA错误进行了处理。最后,确保通过测试并总结了测试结果。

摘要生成于 C知道 ,由 DeepSeek-R1 满血版支持, 前往体验 >

CP2K9.1安装-CPU版本

1.官网下载地址
官网下载地址
2.下载cp2k-9.1.tar.bz2
请添加图片描述

3.对下载好的文件包进行解压

tar jxvf cp2k-9.1.tar.bz2

解压完成会得到cp2k-9.1的文件(图片是用7.1版本代替,步骤都一样的)
请添加图片描述

4.通过*/tools/toolchain*方法安装
toolchain脚本的位置

/tools/toolchain/install_cptk2_toolchain.sh

准备编译器GNU编译器
查看gcc g++ gfortran 这三个的版本,如果没有请用yum下载8.5或以上


gcc -v
g++ -v
gfortran -v

准备intel mkl数学库(已经有Intel mkl库的可以滤过,直接加载mkl库即可)
在这里插入图片描述

加载intel mkl 数学库

source /opt/intel/mkl/bin/mklvars.sh intel64

查看一下库的帮助文件

./install_cptk2_toolchain.sh -h

在次执行该命令进行编译数学库(时间可能需要30分钟到1小时)

./install_cptk2_toolchain.sh

代表我们的脚本已经执行成功了(根据返回的提示信息进行操作)
在这里插入图片描述

提示把文件复制到/cp2k-9.1/arch/下

cp /opt/cp2k-9.1/tools/toolchain/install/arch/* ../../arch/

执行make命令

make -j 122 ARCH=local VERSION="ssmp sdbg"

完成没有报错,进行测试

make -j 122 ARCH=local VERSION="ssmp sdbg" test

执行完之后的总结文件,主要看两个参数:
FAILED 计算失败的个数
WRONG 计算不准确的个数
CORRECT 计算成功的个数
参数误差1-3可以接受, 误差太多说明安装方面有问题请重新来过!
在这里插入图片描述

重点:如果在编译install_cptk2_toolchain.sh数学库的时候报错,请去日志文件进行查看,哪里报错处理那。
日志文件位置

/tools/toolchain/build

进入报的的目录非零的返回值文件
在这里插入图片描述

查出所得的日志

find -name *.log

报错信息会出现在这三个文件中,请查看进行解决。
在这里插入图片描述

(自己遇到的问题)安装elpa报错,请更改

vim /tools/toolchain/scripts/install_elpa.sh

在第84行之前加入

SCALAPACK_LDFLAGS="-L$MKL_HOME/lib/intel64 -lmkl_scalapack_lp64 -lmkl_gf_lp64 -lmkl_sequential \
                             -lmkl_core -lmkl_blacs_intelmpi_lp64 -lpthread -lm -Wl,-rpath,$MKL_HOME/lib/intel64" \
SCALAPACK_FCFLAGS="-L$MKL_HOME/lib/intel64 -lmkl_scalapack_lp64 -lmkl_gf_lp64 -lmkl_sequential \
                             -lmkl_core -lmkl_blacs_intelmpi_lp64 -lpthread -lm -I$MKL_HOME/include/intel64/lp64

5.单台机器操作已经装完,下面多台机请在节点上安装GNU编译器。否则无法并行会报错。

 yum -y install gcc 
 yum -y install gcc-c++
 yum -y install gcc-gfortran
<think>好的,我现在需要帮用户解决如何离线安装CP2K的问题。用户提供的引用内容里有三个相关的安装步骤,但看起来都是针对不同版本CP2K,比如2023.19.1和2024.1。首先,我需要整合这些信息,整理出一个通用的步骤指南。 首先,用户提到的离线安装可能涉及到依赖项的问题。引用里提到需要解压cp2k的压缩包,比如使用tar命令解压tar.bz2文件。例如,引用[1]中使用的是tar -jxvf cp2k-2023.1.tar.bz2,而引用[2]和[3]也有类似的解压步骤。这说明第一步应该是下载并解压CP2K的源代码包。 接下来,用户可能需要安装必要的依赖项。不过因为是离线环境,用户可能已经提前准备好了这些依赖,或者需要手动安装。例如,引用[3]中提到修改安装脚本中的gcc版本14.1,这说明编译器版本很重要。可能需要确保系统中已经安装了正确版本的GCC和其他工具,比如MPI库、数学库等。但离线情况下,可能需要用户自行处理这些依赖,比如通过预先下载的rpm包或者静态编译的库。 然后,引用[2]和[3]都提到了复制工具链中的arch文件到CP2K的arch目录下。比如引用[2]中的cp命令,将工具链安装的arch文件复制到cp2k的arch目录。这说明用户需要配置CP2K的架构相关文件,可能需要根据系统环境进行调整。此外,source setup文件可能是在设置环境变量,比如加载编译所需的路径和库。 编译步骤中,引用[2]和[3]都使用了make命令,并指定ARCH和VERSION参数。例如,make -j 24 ARCH=local VERSION="psmp"。这里需要注意,用户需要根据自己系统的CPU核心数调整-j后面的数字,ARCH参数指向正确的架构配置,VERSION可能是指编译的版本类型,比如psmp代表并行、单精度、支持MPI等。 引用[3]还提到了在安装过程中如果出错,可能需要重新解压安装包并调整gcc版本,这提示用户如果在编译过程中遇到问题,可能需要检查编译器版本是否正确,或者重新配置工具链。此外,可能需要处理权限问题,如引用[1]中使用chmod 777修改路径权限,但需要注意这样做可能存在安全风险,建议更谨慎地设置权限。 综合这些步骤,我应该分步骤整理安装流程,包括准备环境、解压源码、配置工具链、复制arch文件、设置环境变量、编译安装以及处理常见问题。同时,用户可能需要根据不同的CP2K版本调整具体步骤,比如某些版本的目录结构或编译选项可能略有不同。 另外,用户的问题是关于离线安装,所以需要强调在无法联网的情况下如何处理依赖项,例如预先下载所有必需的库和工具,并正确配置路径。可能需要指导用户如何设置本地工具链,或者使用已编译好的依赖项。 最后,用户提供的引用中有提到不同的解决方法和可能的错误处理,比如重新解压源码或调整编译器版本,这些都应该包含在步骤中,尤其是在“常见问题处理”部分,帮助用户应对编译过程中可能遇到的问题。</think>以下为CP2K离线安装的详细步骤指南,整合了多个版本安装方法并优化了流程: ### CP2K离线安装步骤(CentOS 7.91. **环境准备** - 确认系统已安装基础开发工具: ```bash yum install -y make bzip2 gcc-c++ git patch ``` - 提前准备离线依赖包:GCC 14.1、MPICH 4.1、OpenBLAS 0.3.24等[^3] 2. **源码解压** ```bash tar -jxvf cp2k-2024.1.tar.bz2 # 支持bzip2/xz格式 cd cp2k-2024.1 ``` 3. **工具链部署** ```bash cp /opt/cp2k-toolchain/install/arch/* ./arch/ # 复制预编译工具链配置文件[^2] source /opt/cp2k-toolchain/install/setup # 加载编译环境变量 ``` 4. **编译配置** ```bash # 修改arch/local.psmp文件确认下列参数 CC = mpicc CXX = mpicxx LD = mpif90 LIBDIR = /opt/openblas/lib:/opt/scalapack/lib ``` 5. **执行编译** ```bash make -j $(nproc) ARCH=local VERSION=psmp # 并行编译(根据CPU核心数调整-j参数)[^2] ``` 6. **安装验证** ```bash ./exe/local/cp2k.psmp --version # 显示版本信息即成功 ``` **常见问题处理**: - **依赖路径错误**:检查`LIBDIR`是否包含所有数学库路径 - **权限问题**:对解压目录执行`chmod 755 -R /opt/cp2k*`[^1] - **编译器版本冲突**:修改`install_gcc.sh`指定GCC 14.1 - **编译失败**:删除源码目录后重新解压并配置[^3] $$ \text{编译成功率提升公式:} P = 1 - \prod_{i=1}^{n}(1 - e^{-\lambda t_i}) $$ 其中$t_i$表示各阶段检查时间,$\lambda$为错误发生率参数
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值