原标题:老司机带你解锁ImageJ的各种技术姿势
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ImageJ(官网:https://imagej.nih.gov/ij/ )是一个基于java的公共的图像处理软件,它是由National Institutes of Health(NIH)开发的一款功能强大的免费软件,在生物及医学图像分析中起着非常重要的作用。
下图是ImageJ官网的界面,在Download下根据自己系统选择对应的软件下载,ImageJ可以适用于Mac OS X,Linux以及Windows系统(不受电脑系统限制)。生物医学中计数非常常见,下面我们来一起玩转mageJ计数。
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手动计数
使用Multi-Point工具进行计数
打开ImageJ软件,File,Open打开待分析图片:
点击point工具,右击,选择Multi-Point工具,手动点击进行计数:
点击Analyze–>Measure,可以看见此时计数数量为23个,保存图片即可。
Cell Counter进行细胞计数
点击Plugins–>Analyze–>Cell Counter,界面如下:
点击Initialize,可以对不同类型的细胞进行计数:
可以看见Type1、Type2、Type3计数结果分别为2、1、2个。本方法可以同时对不同类型的细胞进行计数。点击Cell Counter中的Results就可以看见不同类型细胞的数量。Cell Counter与Multi-Point手动计数方法相比可对不同细胞类型计数。
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常规自动计数过程
打开ImageJ软件,File –>Open打开需要分析的图片:
Image –> Type -> 8-bit (改为灰度图像)
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