导读
1. ROC曲线:
ROC曲线(receiver operating characteristic curve,简称ROC曲线),以真阳性率(灵敏度)为纵坐标,假阳性率(1-特异度)为横坐标绘制的曲线。ROC最初是在二战中被提出的信号检测理论,后来又被引入了心理学进行信号的知觉检测,现在ROC曲线已经成为非常重要和常见的统计分析方法。
2. ROC分析:
ROC分析首先是根据学习器的预测结果对样例进行排序,按此顺序逐个把样本作为正例进行预测,每次计算出两个重要量的值(TPR、FPR),分别以它们为横、纵坐标作图。AUC的值是ROC曲线下面积的大小,用来评价分类器的performance。通常,AUC的值介于0.5到1.0之间,较大的AUC代表了较好的performance。
如何制作如下图的多指标ROC曲线?
ROC.png
一、软件准备
R:利用rnorm函数产生随机数,作为graphpad绘图的输入文件。
Graphpad prism5:绘制ROC曲线。
二、过程
1. 利用R模拟输入文件
产生两组正态分布随机数,控制mean和SD。
GroupA
GroupB
保存。将两组数据均分给Genus和Phylum。
write.xlsx(data1, file="C:/mywd/data1.xlsx")
write.xlsx(data2, file="C:/mywd/data2.xlsx")
整理后如下:
R模拟数据.png
2. 打开graph prism5,Creat一个column图。
2.png</