SOAPdenove 安装心得

本文将详细指导您解决在使用SOAPdenovo2进行基因组组装时,遇到的multi_threads.cpp相关错误。通过在sparsePregraph目录下特定文件头文件中加入unistd.h,可以有效解决此问题。文章提供了具体步骤和截图说明,确保您的软件安装顺利进行。

1、下载地址 :http://soap.genomics.org.cn/soapdenovo.html

2、安装(必须为root

su

tar -zxf SOAPdenovo2-src-r240.tgz

cd SOAPdenovo2-src-r240/

make

 

出现下图错误:

解决方法:

       在sparsePregraph目录下multi_threads.cpp、build_preArc.cpp、pregraph_sparse.cpp 文件头文件中加入:

#include "unistd.h"

修改完后 重新make

 

转载于:https://www.cnblogs.com/zengx/p/3599666.html

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