去查了一下.NET 2005的文档,查到App_Code 文件夹可以包含任意数量的文件和子文件夹,可编译时仍会将所有代码编译成单个程序集,也就是App_Code.dll,感觉好像不能按文件夹的名字生成以文件夹名称命名的Dll。不过,App_Code有个特性,可以使用多种编程语言编写自定义类,由于App_Code 文件夹中的源代码要编译成单个程序集,所以不同语言编写的代码必须放在不同的子文件夹中,即同一文件夹下的代码必须是用同一种语言编写的,再通过对Web应用程序进行配置,使其将 App_Code 文件夹的子文件夹作为独立的可编译单元处理,因此生成的Dll必定是按编程语言独立的Dll。
在项目的App_Code文件夹下建了一个Code2nd子文件夹,将二次开发的共享代码移到子文件夹下,按照帮助文档中的示例代码在Web.Config中进行配置:
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<compilation debug="false">
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<codeSubDirectories>
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<add directoryName="Code2nd" />
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</codeSubDirectories>
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</compilation>
生成网站,顺利通过,到生成的网站目录的Bin文件夹下浏览了一下,有了一个新的Dll,文件名为App_SubCode_Code2nd.dll,显然是Code2nd子文件夹里的代码生成的Dll^_^。 
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再做一个测试,在App_Code文件夹下又建了两个文件夹,写了两段简单的测试代码,一个用C#,一个VB,生成也成功了,可见,用这种方法可以对比较大的Dll进行拆分,对于Web应用程序共享代码的升级更新也能够实现部分代码块的更新。
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主要就两部分
一个是在App_Code文件夹内建一个子文件夹
另一个是在App.Config的codeSubDirectories键里配置路径