R语言igraph 包-构建网络图

本文介绍了如何使用R语言中的igraph包来构建和可视化网络图。通过数据框创建包含节点和边的图,并展示了如何设置图的属性,如方向和节点位置。还提到了自动布局算法在不同类型的图中的应用。

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igaph 是一个项目,目标是建立一条简单,易用的网络分析工具,有 R, python, C/C++ 等语言的具体实现;

项目主页:

http://igraph.org/

在R语言中,对应的就是 igraph 这个R包

安装:

install.packages("igraph")

使用:

对于图 graph 这种数据结构而言,最基本的元素包括节点(node) 和 边(节点之间的连线,edge);

igraph 这个R包提供了很多种创建graph的方式,我们先看一个最基本的例子,从数据框创建一个graph;

我们将要创建的graph 如下:

可以看到,这个graph 包括5个节点,首先创建一个数据框,这个数据框中的每一行是一个节点,每一列是节点的属性

代码如下:

> actors <- data.frame(name=c("Alice", "Bob", "Cecil", "David",
                            "Esmeralda"),
                     age=c(48,33,45,34,21),
                     gender=c("F","M","F","M","F"))

> actors
       name age gender
1     Alice  48      F
2       Bob  33      M
3     Cecil  45      F
4     Davi
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