paraview 3.12.0 windows下编译成功 小记

本文提供Paraview从源码编译安装的详细步骤,包括所需工具如cmake、qt等的准备,以及编译过程中的关键设置,特别强调了BUILD_SHARED_LIBS选项的重要性。

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1. 先看其官方文档 http://paraview.org/Wiki/ParaView:Build_And_Install

2. 准备工具:

cmake (这个下最新版本就行)

qt   (官方文档里推荐4.6.2,不过我用4.8.0也没问题)

ffmeg(.avi)movie libraries (如果你的系统不支持avi,那就要装,windows是默认支持的,不用装)

MESA 3D libraries (如果你在运行paraview时,硬件不支持opengl,才要装,这个我也没装)

ParaView Source Code

msysgit

3. 主要编译步骤

(1)运行cmake-gui.exe,然后,分别在where is the source code, where to build the binaries分别指向peraview源码,要生成paraview的文件夹,两个一定要在不同的文件夹。

where_is_the_source_code

(2)设置好后,点configure按钮,进行配置,第一运行时,会让你选择编译成什么目标类型,我用的是vs2010编译,所以选择”visual studio2010“,继续,会出现配置错误,因为你还没有选择qt bin的位置,在“QT_QMAKE_EXECUTABLE”上,设置你的qmake.exe的位置。直接安装的qt,要指向你的“QtSDK\Desktop\Qt\4.8.0\msvc2010”中的qmake.exe。

这里,有一个极为重要的选项要设置:那就是“BUILD_SHARED_LIBS”一定要选上,否则会在vs编译时出现:vtkRendering.lib(vtkOpenGLFreeTypeTextMapper.obj) : error LNK2019: unresolved external symbol "public: float __thiscall FTFont::Advance(char const *)" (?Advance@FTFont@@QAEMPBD@Z) referenced in function "public: virtual void __thiscall vtkOpenGLFreeTypeTextMapper::GetSize(class vtkViewport *,int * const)" 这个vtkRendering.lib的错误,这时由于vtk的一个bug,http://vtk.1045678.n5.nabble.com/Build-from-GIT-Master-Linker-errors-td5429952.html

(3) Generate,成功后,就会在build 文件夹下看到visual studio工程了。

image

(4)打开paraview.sln,编译ALL_BUILD,成功。

转载于:https://www.cnblogs.com/phnix/archive/2012/02/17/2355283.html

内容概要:本文详细介绍了扫描单分子定位显微镜(scanSMLM)技术及其在三维超分辨体积成像中的应用。scanSMLM通过电调透镜(ETL)实现快速轴向扫描,结合4f检测系统将不同焦平面的荧光信号聚焦到固定成像面,从而实现快速、大视场的三维超分辨成像。文章不仅涵盖了系统硬件的设计与实现,还提供了详细的软件代码实现,包括ETL控制、3D样本模拟、体积扫描、单分子定位、3D重建和分子聚类分析等功能。此外,文章还比较了循环扫描与常规扫描模式,展示了前者在光漂白效应上的优势,并通过荧光珠校准、肌动蛋白丝、线粒体网络和流感A病毒血凝素(HA)蛋白聚类的三维成像实验,验证了系统的性能和应用潜力。最后,文章深入探讨了HA蛋白聚类与病毒感染的关系,模拟了24小时内HA聚类的动态变化,提供了从分子到细胞尺度的多尺度分析能力。 适合人群:具备生物学、物理学或工程学背景,对超分辨显微成像技术感兴趣的科研人员,尤其是从事细胞生物学、病毒学或光学成像研究的科学家和技术人员。 使用场景及目标:①理解和掌握scanSMLM技术的工作原理及其在三维超分辨成像中的应用;②学习如何通过Python代码实现完整的scanSMLM系统,包括硬件控制、图像采集、3D重建和数据分析;③应用于单分子水平研究细胞内结构和动态过程,如病毒入侵机制、蛋白质聚类等。 其他说明:本文提供的代码不仅实现了scanSMLM系统的完整工作流程,还涵盖了多种超分辨成像技术的模拟和比较,如STED、GSDIM等。此外,文章还强调了系统在硬件改动小、成像速度快等方面的优势,为研究人员提供了从理论到实践的全面指导。
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