关于RNA-Seq数据去接头(Adapter)这事需要讲一讲

最新推荐文章于 2025-08-12 18:06:10 发布

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本文详细介绍了RNA-Seq数据中接头、barcode的概念，以及使用cutadapt去除接头的过程和相关参数设置，强调理解原理的重要性，以避免处理数据时出现错误。

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关于RNA-Seq数据去接头(Adapter)这事需要讲一讲

RNA-Seq
adapter
barcode
cutadapt

首先来了解一下三个概念： 1、adapter是一段短的序列已知的核酸链，用于链接序列未知的目标测序片段。 2、barcode，也称为index，是一段很短的寡居核酸链，用于在多个样品混合测序时，标记不同的样品。 3、insert是用于测序的目标片段，因为是包括在两个adapter之间，所以被称为“插入”片段。

首先来了解一下三个概念：

1、adapter是一段短的序列已知的核酸链，用于链接序列未知的目标测序片段。

2、barcode，也称为index，是一段很短的寡居核酸链，用于在多个样品混合测序时，标记不同的样品。