[R] read.table/read.delim读入数据行数变少？

最新推荐文章于 2024-07-20 09:40:13 发布

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本文探讨了在使用R的`read.table`和`read.delim`函数读取数据时，行数意外减少的问题。作者发现由于数据中存在单引号导致字段处理异常。通过使用`readr`包的`read_csv`函数解决了这个问题，并建议在遇到类似情况时检查数据格式和使用`col_names = FALSE`参数进行排查。

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以为对read.table/read.delim很熟了，谁知又掉坑里了。

我有个3万多行的数据集，包括样品表达量和注释信息。大概长这样：

本来3万多行，可是读进来的时候变成了1万多行，而且read.delim和read.table减少的行数还不一样。我用Excel打开，再另存为txt格式读入后，数据行数变回正常的3万多。

MP <- read.delim("combine_test.txt",sep = '\t',header = T)
MP1 <- read.table("combine_test.txt",sep = '\t',header = T)
MP2<- read.delim("new_combine_test.txt",sep = '\t',header = T)

所以我在想是不是Rstudio的问题。于是我在Linux中测试了下，发现更诡异。

MP <- read.table("combine_test2.txt",header = T,sep='\t')
dim(MP)
MP2 <- read.delim("combine_test2.txt",header = T,sep='\t')
dim(MP2)
write.table(MP,"out.tx