高通量测序中，reads、contigs、scaffold之间的联系

最新推荐文章于 2024-10-17 11:53:25 发布
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原文链接：http://www.cnblogs.com/lmt921108/p/7501436.html
本文介绍了测序拼接过程中的基本概念，包括read、contigs、scaffold等，并解释了singleton和unigene的概念。这些术语常见于de novo拼接过程中。

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read：测序时，产生的较短的原始序列叫read

contigs：有多个reads通过片段的重叠，组装成一个更大的read，称为contigs

scaffold：多个contigs通过片段的重叠拼接成更长的scaffold；

从上面的解释来看，可以发现这些命名应该比价常出现在de novo拼接当中。

一个contigs组装之后，鉴定发现是编码蛋白的基因，就叫做singleton

scaffold，经鉴定发现它是编码蛋白的基因，就叫做unigene

转载于:https://www.cnblogs.com/lmt921108/p/7501436.html

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