ctab提取dna流程图_质粒、噬菌体和细菌胞外DNA提取方法

本文详细介绍了质粒DNA的碱裂解法提取,包括注意事项和环境样本质粒DNA的提取流程。此外,还阐述了胞外DNA (eDNA) 的沉积物和水体提取方法,以及噬菌体DNA的提取步骤,为分子生物学实验提供参考。

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质粒的提取

细菌中的质粒是一类双链、闭和环状的DNA,大小范围从1kb至200kb以上不等。质粒通常存在于细胞质中,其是独立于细胞染色体之外的、具有自主复制能力的遗传单元,通常情况下可持续稳定地在宿主细胞内复制并传代,质粒目前已成为最常用的基因克隆载体

碱裂解法提取质粒DNA

碱裂解法是一种应用最为广泛的制备质粒DNA的方法,其基本原理为:当菌体在NaOH和SDS溶液中裂解时,蛋白质与DNA发生变性,当加入中和液后,质粒DNA分子能够迅速复性,呈溶解状态,离心时留在上清中,蛋白质与染色体DNA不变性而呈絮状,离心时可沉淀下来。

碱裂解法具有快速、得率高、几乎无基因组DNA污染等特点,使用该方法所得的质粒DNA能够满足细菌转化、DNA片段酶切、常规克隆及标记等基本分子生物学实验的要求。

注意事项

  1. 裂解液和菌体的比例,为了保证菌体的充分裂解从而达到最佳的提取效果,裂解液和菌体的比例十分重要,要按照实际的实验所需,确定所用菌体的量,之后根据试剂盒的推荐,选择合适的裂解液与菌体比例;
  2. 蛋白质的沉淀,在4℃下蛋白质沉淀效率较高,因此,在加入Solution III后可在4℃静置一段时间并采用4℃离心,以提高蛋白质的去除效果;
  3. 质粒的纯化,碱裂解法提取的质粒DNA不经其它纯化步骤就已经具有了较高的纯度,配合其它纯化方法,如氯仿/醇沉淀、吸附柱等,可以获得纯度很高的质粒;
  4. RNA的去除,在Solution I 中加入RNase A (100μg/mL) 可以
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