c++ string.trim()去不掉全角空格_数据挖掘 | GEO官方不编程差异表达分析工具GEO2R(下篇)...

本文介绍了GEO2R分析差异甲基化数据后的处理方法,包括如何去除双引号、转换为表格格式以及筛选显著差异的甲基化位点。通过Excel操作和设置筛选条件,如P值和t统计量,可以直接从探针水平过渡到基因水平,进行进一步的联合分析。此外,文章还提供了文献验证的过滤标准。

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承接上文

GEO官方不编程差异表达分析工具-GEO2R

上文主要讲GEO2R的使用,本文主要解决后续的几个问题:

1、GEO2R的分析结果如何保存

2、差异甲基化筛选阈值

3、哪些基因存在显著差异的甲基化水平?

本篇以27k甲基化芯片数据GSE73003为例:

fef7a1b21d3dd45bd78e7a2b87d1e34f.png

点击Save all results之后,在新页面中显示结果内容如下:

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非常别扭,一来并未直接生产excel表格文件,二来还有双引号!

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