TITLE:Environmental DNA reveals seasonal shifts andpotential interactions in a marine community
译名:环境DNA揭示了海洋群落的季节变化和潜在的相互作用
期刊:nature communications
日期:2020年1月
下载链接:
https://www.nature.com/articles/s41467-019-14105-1
一.简述
环境 DNA (eDNA) 分析允许同时检查多个营养水平和生命领域的生物,提供有关与生态系统变化相关的复杂生物相互作用的关键信息。在这里,我们使用 eDNA 的多位点扩增子测序来调查来自加利福尼亚州蒙特雷湾的 18 个月(2015-2016 年)时间序列海水样本的生物多样性。生成的数据集包含从微生物到哺乳动物的 663 个分类群(在科或更高分类等级)。我们推断了群落组成的变化,揭示了类群之间推定的相互作用,并确定了这些群落与环境特性之间的相关性。社区网络分析提供了所有生命领域中预期的捕食者-猎物关系、营养联系和季节性变化的证据。
二.结果概述
eDNA 方法的发展为了解海洋生物多样性提供了一个独特的视角,可以同时检查多个营养水平和生命领域的生物,从而提供有关与生态系统变化相关的复杂生物相互作用的关键信息。
海洋生物群可以有效地聚集成群落(子网络),这些群落的组成和丰度会随着时间的推移而波动。我们确定了六个子网络,它们代表不同的群落及其随时间的变化。春季/夏季类群(橙色、黄色、绿色子网络)之间丰富度的 eDNA 观察结果与秋季/冬季类群(灰色、蓝色、黑色)明显不同。所有子网都与环境变量相关,分类单元丰富度的季节性反映了与冬季较低的