在线作图|在线做完整的Lefse分析

原创

于 2021-12-29 09:30:38 发布 · 4.5k 阅读

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#lefse

TUTU网站现提供Lefse（LDA Effect Size）分析工具，包括LDA值柱状图、物种分类分支图等。用户可免费使用，需注意文件格式和内容要求，确保数据正确上传。完成分析后，结果以PDF格式提供，支持进一步编辑。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

前言

今天小编给大家介绍的是TUTU（https://www.cloudtutu.com/）网站上新添的Lefse分析，即LDA Effect Size分析。咱之前有上过这个分析（lefse），但是只能画出LDA值柱状图，今天新添的工具lefse2基本可以实现完整的分析内容，包括LDA值柱状图、物种分类分支图、组间丰度柱状图等等。
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Lefse分析文献应用举例：
Fig. 7 The main taxa of bacteria that were different in HMG vs. SMG vs. FMG. a: Cladogram of the main taxa of mi-crobiota that were different on the basis of LEfSe analysis. b: LEfSe analysis (taxa with LDA score > 4). (The different dietary sugars modulate the composition of the gut microbiota in honeybee during overwintering)
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Fig.2 The linear discriminant analysis (LDA) effect size (LEfSe) was used to identify the biomarkers with significant differences between the two groups: c 4HF vs 4 AM and d 4HF vs 4SV. Values are presented as mean ± SEM. *P <