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在EvoFormer中，主要是将图网络（Graph networks）和多序列比对（MSA）结合完成结构预测，Alphafold2使用Transformer结构，不管是MSA还是残基-残基对的信息更新都使用了Attention机制，结构模块的更新使用了三角法则，简化了计算的复杂度，准确率也提高了不少.2021年底，谷歌的DeepMind团队的采用人工智能方法的AlphaFold2算法在生物界引起了极大的轰动，它能准确地预测蛋白质的结构，AlphaFold2是当今预测蛋白质3D结构的最强工具。