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原创 linux 中一个对于每个文件夹执行的模板,很多都可以套用

【代码】linux 中一个对于每个文件夹执行的模板,很多都可以套用。

2024-12-18 22:43:56 106

原创 通过化学式返还出包含的原子

【代码】通过化学式返还出包含的原子。

2024-12-11 23:19:48 436

原创 对POSCAR和CONTCAR备份

对POSCAR和CONTCAR备份。

2024-12-05 15:02:14 252

原创 检查精度,并且重新修改精度后提交脚本

修改EDIFF的一个尝试。

2024-12-03 10:57:23 146

原创 两点距离计算

计算两个点之间的距离。

2024-11-24 19:58:10 150 1

原创 Direct转化为Cartesian

脚本把Direct转化为Cartesian。

2024-11-24 19:52:45 182

原创 如何在函数用变量作为变量名称

【代码】如何在函数用变量作为变量名称。

2024-07-10 13:34:28 143

原创 关于坐标系生成转化

通过stack构建坐标系。最后这步再把数据转化为坐标轴的形式。

2024-06-16 09:24:16 129

原创 删除linux中的换行符号^M

sed -i ‘s/\r//g’ ./文件路径。

2024-05-17 13:37:31 278

原创 linux自动停止任务

【代码】linux自动停止任务。

2024-03-31 13:20:32 182 1

原创 自动在每个文件夹下执行脚本

find . -mindepth 2 -maxdepth 2 -type d -exec ls {} ;

2023-11-16 11:32:25 123

原创 DFT_U opt

把循环得到得数列输入INCAR。

2023-11-01 10:15:57 131

原创 dos自动化

【代码】dos自动化。

2023-10-26 20:40:06 129 1

原创 opt自动优化

【代码】opt自动优化。

2023-10-23 11:27:54 111 1

原创 linux自动scf脚本

linux脚本直接进行scf操作

2023-10-20 12:26:35 138 1

原创 高通量换原子步骤方案

解释 -i表示直接对文件进行修改,6限定了搜索范围,s搜索操作,搭配正则表达式Fe换Si, 后面的是修改的文件名字。首先是一个换原子的方案。

2023-09-17 21:23:10 171 1

原创 python绘图之台阶图方案

python绘图方案

2023-09-05 16:06:00 653

原创 python-docx 文本操作

run的理解。

2023-08-12 21:09:36 115 1

原创 python-docx 页眉的处理

(这个不用管)首先Document对象没有默认的段落,但有一个默认的节。获取默认章节,并且在后面添加新章节。对于页眉的讨论先要理解节的概念。

2023-08-12 20:28:53 1190 1

原创 python-docx段落设置

python对word的批量操作

2023-08-11 18:23:08 582 1

原创 算例06-过渡态搜索

首先以算例05为基础对于G-Fe-OH与G-Fe-O-H进行结构优化。

2023-08-10 18:32:53 341 1

原创 算例04-Jmol可视化软件的应用

1.下载Java运行环境

2023-07-26 15:31:48 1345 1

原创 算例05-单原子催化OER案例

一套完整电催化体系算例 有点长

2023-07-08 14:02:32 402 1

原创 算例03-震动频率全套

bigbro推荐了一个网址还可以 http://www.chemspider.com/Default.aspx其中可以搜索到.mol文件(操作的时候复制的时候不好复制是可能会用到Alt + shift)这里首先一个先学一下如何书写POSCAR首先写出头头此处应该再写一个移动原子的脚本(。。。。。)以后再写。

2023-07-07 20:37:50 496 1

原创 算例02-O2计算案例

通过非常简单的案例,论述了如何从化学知识判断结构合理性,MAGMOM设定

2023-07-07 10:44:47 243 1

原创 算例01-以O原子为切入理解磁矩信息

因此所以氧原子含有两个单电子,具有磁性,且磁矩为2。

2023-07-06 21:01:32 460 1

原创 输出文件详解-待续

CONTCAR是POSCAR优化后的文件,当第一个离子步跑完的时候会开始更新,因此是实时更新的。这里有个习惯需要养成:就是每次的续算需要保存以前的一些数据。脚本名字为: save_calculations.sh。

2023-07-06 20:27:47 275 1

原创 vasp输入文件INCAR参数详解

3)对所有体系,如果想获取更加精确能量的时候用-5,但这时候如果K点数目小于3,程序则会罢工;K 点少,半导体或者绝缘体,那么只能用 ISMEAR = 0;物理含义:ISMEAR这一个参数规定的费米面附近电子是否严格的遵守费米面以上没有电子,-5含义,时候表示严格遵守费米面上没有电子,0表示有半填充的能带。4)在DOS能带计算中,使用ISMEAR= -5 用于获取精确的信息。ISMEAR=0能带是要跨越费米面的,1)不同的值对应的是不同的展宽方法;总结:金属不能用-5。

2023-07-06 13:13:28 4464 3

原创 vasp操作相关技巧

查看能量

2023-07-05 10:25:03 2565

原创 liunx脚本-批量生成POTCAR

其中“xargs -I {}”是一个参数传递的命令。${i}是循环内部的参数传递。本脚本的难点主要在于下面这句。

2023-07-05 09:32:49 570

原创 vasp输入文件 KPOINTS POTCAR 制作

KPOINTS POTCAR INCAR等关键输入文件的书写

2023-07-05 09:07:56 2748

原创 Markdown使用备份

Markdown使用技巧

2023-07-05 08:36:40 120

算例06-过渡态搜索具体输入文件

算例06-过渡态搜索具体输入文件

2023-08-10

算例06-过渡态搜索 算例的具体文件

本算例资源

2023-08-10

OER算例的INCAR POSCAR KPOINTS POTCAR等等的

OER算例的INCAR POSCAR KPOINTS POTCAR等等的,复现时候可以在这里下载

2023-07-08

梁昆淼力学答案-第一章.pdf

物理学考研必备神器,梁昆淼力学答案

2021-06-10

空空如也

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