Max Sequence (DP)

本文探讨了最大子段和问题的一种特殊情况,即m=2的情况,并提供了详细的DP算法实现思路及代码示例。

摘要生成于 C知道 ,由 DeepSeek-R1 满血版支持, 前往体验 >

Give you N integers a1, a2 ... aN (|ai| <=1000, 1 <= i <= N).


You should output S. 

input 

The input will consist of several test cases. For each test case, one integer N (2 <= N <= 100000) is given in the first line. Second line contains N integers. The input is terminated by a single line with N = 0.

output

For each test of the input, print a line containing S.

sample input

5
-5 9 -5 11 20
0

sample output

40

最大m子段问题,此题中m=2。主要方法还是DP,其实理解题意以后代码的编写不是很困难,就是这道题目很难理解,数学弱鸡瑟瑟发抖。

基本上还是用我们熟悉的最大子段和的方法。读入数据是时做一次DP,
得到从前往后到第i(0=<i<n)个元素处时的最大子段和,然后再从后往前反向做一次DP,
加上前面求得的正向的最大字段和即可求出一个最大值。

#include<cstdio>
#include<iostream>
#include<cstring>
#include<algorithm>
using namespace std;
const int inf=-0x3fffffff;
int num[100001], dp[100001];
int main()
{
    int n,max,sum,s;
    while(scanf("%d",&n))
    {
        if(n==0)
        break;
		sum=0;
        max=inf;
        for(int i=1;i<=n;i++)
        {
            scanf("%d", &num[i]);
            sum +=num[i];
            if(sum>max)
                max=sum;
            dp[i]=max;
            if(sum<0)
                sum=0;
        }
        dp[0]=s=max=inf;
        sum=0;
        for(int i=n;i>0;i--) 
        {
            sum+= num[i];
            if(sum>max)
                max=sum;
            if(s<max+dp[i-1])
                s=max+dp[i-1];
            if(sum<0)
                sum=0;
        }
        printf("%d\n",s);
    }
}


在计算机科学和生物信息学中,"sequence-aligned"(序列对齐)通常指将两个或多个序列按照某种规则进行比对,以揭示它们之间的相似性、差异性或进化关系。这种对齐过程可以用于字符串、基因组序列、蛋白质序列等多种类型的数据。 ### 在计算机科学中的含义 在计算机科学中,**sequence-aligned**常用于描述数据流或协议中字节序列的对齐方式。例如,在网络通信协议中,特定的标记(Marker)可以被插入到数据流中,接收端通过检测这些标记来识别固定间隔的位置,从而确保数据帧的正确解析。例如,TCP协议中可以通过固定的Marker间隔来实现FPDU(Frame Protocol Data Unit)头部的对齐[^1]。这种方式有助于简化数据处理流程并提高解析效率。 ### 在生物信息学中的含义 在生物信息学中,**sequence-aligned**通常指的是通过比对算法(如BLAST、ClustalW等)将DNA、RNA或蛋白质序列进行排列,使得具有相似功能或结构的区域能够对应起来。这种对齐可以帮助研究人员识别保守区域、推断进化关系以及预测功能。常见的对齐方法包括: - **全局对齐**:适用于长度相近且整体相似的序列。 - **局部对齐**:关注序列中部分相似的区域,适用于长度差异较大或仅部分区域相似的情况。 - **多序列对齐**:用于比对多个序列,揭示更广泛的进化关系和保守模式。 ### 示例代码:全局序列比对(Needleman-Wunsch算法) 以下是一个简单的Python实现,使用动态规划方法进行全局序列比对: ```python def needleman_wunsch(seq1, seq2, match_score=1, gap_cost=-1, mismatch_cost=-1): n = len(seq1) m = len(seq2) # 初始化得分矩阵 dp = [[0] * (m + 1) for _ in range(n + 1)] for i in range(1, n + 1): dp[i][0] = i * gap_cost for j in range(1, m + 1): dp[0][j] = j * gap_cost # 填充得分矩阵 for i in range(1, n + 1): for j in range(1, m + 1): match = dp[i - 1][j - 1] + (match_score if seq1[i - 1] == seq2[j - 1] else mismatch_cost) delete = dp[i - 1][j] + gap_cost insert = dp[i][j - 1] + gap_cost dp[i][j] = max(match, delete, insert) # 回溯生成比对结果 aligned_seq1 = [] aligned_seq2 = [] i, j = n, m while i > 0 or j > 0: if i > 0 and j > 0 and dp[i][j] == dp[i - 1][j - 1] + (match_score if seq1[i - 1] == seq2[j - 1] else mismatch_cost): aligned_seq1.append(seq1[i - 1]) aligned_seq2.append(seq2[j - 1]) i -= 1 j -= 1 elif i > 0 and dp[i][j] == dp[i - 1][j] + gap_cost: aligned_seq1.append(seq1[i - 1]) aligned_seq2.append('-') i -= 1 else: aligned_seq1.append('-') aligned_seq2.append(seq2[j - 1]) j -= 1 return ''.join(reversed(aligned_seq1)), ''.join(reversed(aligned_seq2)) # 示例使用 seq1 = "GATTACA" seq2 = "GCATGCU" aligned_seq1, aligned_seq2 = needleman_wunsch(seq1, seq2) print(f"Aligned Sequence 1: {aligned_seq1}") print(f"Aligned Sequence 2: {aligned_seq2}") ``` ### 相关问题 1. 如何在网络协议中实现FPDU头部的对齐? 2. Needleman-Wunsch算法与Smith-Waterman算法在序列比对中有何区别? 3. 生物信息学中常用的多序列比对工具有哪些? 4. 序列对齐技术如何应用于蛋白质结构预测? 5. 在计算机科学中,如何利用序列对齐优化数据传输效率?
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值