AlphaFold 3 – 谷歌DeepMind开源的结构预测统一框架

AlphaFold 3是什么

AlphaFold 3是谷歌DeepMind团队推出的AI模型，能预测蛋白质、核酸（DNA和RNA）、小分子、离子及修饰残基等生物分子的三维结构。模型在结构预测的准确性上取得革命性进展，对药物设计、科研和生物医学领域具有重大影响。基于开源，AlphaFold 3让全球科学家加速新药和疫苗的研发进程。

AlphaFold 3的主要功能

• 结构预测： AlphaFold 3能预测蛋白质、核酸（包括DNA和RNA）、小分子、离子及修饰残基等几乎所有在蛋白质数据库（PDB）中存在的分子类型的三维结构。
• 药物研发： 帮助研究人员快速筛选潜在的药物靶点，基于预测靶点蛋白的结构，揭示其可能的活性位点和结合口袋，为药物设计提供重要的结构基础。
• 分子相互作用： AlphaFold 3能预测药物分子与靶点蛋白的结合模式，评估药物分子的亲和力和特异性，指导药物化学家进行分子优化。
• 生物分子复合物： AlphaFold 3能处理具有大量残基和多种分子组成的生物分子复合物，有效地整合蛋白质和核酸分子的信息，构建出整个复合物的三维结构模型。

AlphaFold 3的技术原理

• 深度学习框架： AlphaFold 3基于深度学习框架，用大量的生物分子结构数据进行训练，学习分子间相互作用的关键特征。
• Pairformer模块： 引入Pairformer模块替代原有的Evoformer模块，减少多重序列比对（MSA）的处理量，让模型更专注于分子间相互作用。<