R数据分析:多分类问题预测模型的ROC做法及解释

有同学做了个多分类的预测模型,结局有三个类别,做的模型包括多分类逻辑回归、随机森林和决策树,多分类逻辑回归是用ROC曲线并报告AUC作为模型评估的,后面两种模型报告了混淆矩阵,审稿人就提出要统一模型评估指标。那么肯定是统一成ROC了,刚好借这个机会给大家讲讲ROC在多分类问题情形下的具体使用和做法。

ROC 曲线回顾

ROC 曲线(Receiver Operating Characteristic Curve):展示分类模型的真阳性率(TPR) 和 假阳性率(FPR)的关系。

  1. 真阳性率 (TPR):模型正确分类正样本的比例。
  2. 假阳性率 (FPR):模型错误地把负样本判为正样本的比例。

其中的逻辑就是分类问题是要看概率阈值进行类别划分的,取不同的概率阈值,真阳性和假阳性率是不一样的。ROC曲线就是在所有可能的阈值下,绘制 TPR(纵轴) 对 FPR(横轴)的曲线。

而AUC(Area Under the Curve)

机器学习 | 计算分类算法的ROC和AUC曲线以随机森林为例 总之,计算随机森林分类器的ROC AUC分数在Python中是一个简单的过程。sklearn.metrics模块提供了计算ROC曲线、ROC AUC评分和PR曲线的函数。ROC曲线和PR曲线是评估二值分类器性能的有用工具,它们可以帮助基于不同评估指标之间的权衡来选择分类器的最佳阈值。PR(precision-recall)曲线是二元分类问题的另一个评估指标。PR曲线是针对不同分类阈值的精确度(y轴)对召回率(x轴)的图。 阅读详情

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表中有4个可能结果,其中2个结果表明被评价诊断方法的诊断结果是正确的,即病例被诊断为阳性(真阳性;diag.col参考线颜色,diag.lty参考线类型,curve.col, curve.lty, curve.lwd 设置ROC曲线的颜色,类型,宽度,xaxs,yaxs设置原点相交。拟合优度检验计算每个个体结局事件的预测值,并按照预测值的大小对数据进行分组,一般分为5-10组,进行Hosmer-Lemeshow拟合优度检验,考察预测值与实际值的吻合程度,p>0.05,说明模型拟合效果较好。

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