上海交大发布大模型 Venus，可让蛋白质 “定向进化”

2025 年 3 月 22 日，上海交通大学特聘教授洪亮团队发布了蛋白质设计大模型 Venus1。以下是对该模型的具体介绍4：

• 核心功能
  • AI 定向进化：Venus 系列模型可以对一个不尽如人意的蛋白质产品的多种性能进行优化，让它成为一个 “六边形战士” 以满足应用需求。如果想要强化目标蛋白质的某个功能，只需要提供该蛋白质的序列信息，Venus 就可以快速给出一批蛋白质序列改造方案，随后结合实验验证得到最优改造方案。
  • AI 挖酶：Venus 系列模型基于其海量的未知功能蛋白质数据集，可以 “海选超能力战士”，去精准发掘满足苛刻应用需求的具备超常规功能的蛋白质，比如极度耐热、极度耐酸、极度耐碱、极度耐胃肠消化等。
• 技术原理：团队建立了全球最大的蛋白质序列数据集 Venus - POD，含有近 90 亿条蛋白质序列，包含数亿个功能标签。通过对这一庞大数据集的学习，模型掌握了自然界蛋白质序列的组织规则以及它与功能之间的关系，从而能够精准、高效地预测、设计蛋白质的功能，实现从序列到功能的直接映射，将复杂的蛋白质设计变成以需求为导向、配合少量实验输出结果的简单过程。
• 产业应用：Venus 设计的多款蛋白质已进入产业化阶段。例如，在国内生长激素龙头金赛药业的单域抗体耐碱性改造项目中，不到 1 年将普通单域抗体耐碱性提升 4 倍，每年为金赛药业节约上千万元成本，该成果已实现多个批次 5000 升放大生产；对某体外诊断头部公司碱性磷酸酶（ALP）的改造项目中，成功优化 ALP，使其分子活性超国际头部公司产品 3 倍，为超敏检测诊断（如心肌梗塞、阿尔兹海默症）带来巨大价值，目前改造后的 ALP 已进入 200L 规模放大生产阶段。