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原创 snakemake 宏基因组流程全笔记
创建一个新的文件夹raw_fq,将原始数据.R1.fq.gz、.R2.fq.gz传输到此文件夹可用 mv 剪切新建一个mapping.txt 首行不动,一行一样品名称所有代码copy到新文件夹需要修改里面的代码,路径改到当前文件路径workdir:(采用此方法,输出数据质量会高一点)代码中#FastQC判断清洗质量 步骤出现报错,原因是没有创建FastQC文件夹,已修改为,可以自动创建FastQC文件夹并运行程序。
2024-09-20 17:22:53
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空空如也
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