哪些期刊最喜欢生信类SCI文章(1~5分)?

转自:https://www.sohu.com/a/237572866_652735

 

今天来讲讲大家最关心的1~5分生信类的SCI文章发表情况。

为什么说大家最关心1~5分的呢?因为首先,这类文章属于article,被单位所认可和接受。然后1分以下的SCI文章可以说大家都不缺少,甚至可以偏激地认为“一文不值”,而5分以上SCI呢,又太难了,好不容易有个OT(Oncotarget)可以灌灌水,CPB(Cell Physiol Biochem)也可以冲一冲,但OT已死,CPB能坚持多久,大家心中自有分寸。

那么大家肯定比较关注科睿唯安何时公布IF影响因子(据可靠消息,下周四左右会出来),一是关注自己文章的期刊分数,二是看看所谓的“水刊”是否已经不在了。

“灌水一时爽,到头全白忙”,近些年科研中的这些坑我们深受其害,所以咱们要擦亮眼睛,搞清楚哪些期刊比较“危险”,时刻做好心理准备。

好了,咱们一起来看看1~5分的生信类SCI更偏向发表在哪些杂志上。

我们在Pubmed上通过关键词“bioinformatics,TCGA,Gene Expression Omnibus,Arrayexpress”,然后去掉重复后获得了共912篇此类文章。

其中2~3分的文章也是最多的,毕竟此档次也是最实用的一个层次。

2018年的总的生信类文章还是要远远多于2017年的,增长了一倍。

那么师兄从这些文章里面总结了,每个不同分档的SCI文章需要完成的工作量也是不同的,如下:

生信文章分步走↓↓↓

1~2

2~3

3~5

找分子

生信分析找差异

qPCR验证

不必须

不必须

临床数据、预后分析

细胞功能

特征蛋白、表型检测

/

不必须

动物实验

疾病模型:分子、病理数据

/

/

不必须

机制研究

机制研究:A→B→C

/

/

不必须

下面我们来看看不同档次的生信类SCI最喜欢发表的期刊(或者期刊最喜欢生信类文章吧)

(1)1~2分的生信SCI期刊

很显然这个档次的工作量不会很大,往往都不需要做任何的湿实验,没有Q-PCR实验、细胞功能实验这些,有的只是:基因的表达差异分析、蛋白互作网络分析、临床资料的回顾(生存分析等)等等,所以周期往往很短,短平快的骚操作。

仅仅今年上半年的发表量(84篇)就已经超过了去年一整年(78篇),增长速度很快,我们以前说过如果数据挖掘类的文章哪一天变成了meta文章一样烂大街,灌水也就失去了意义,各个单位也会迅速把这类文章拉黑的。

那么再来看看哪些期刊比较喜欢这类文章,容易发表呢?

排名前三的果然是大家心目中的样子:Mol Med Rep、Oncol Lett、Medicine (Baltimore)

杂志名称

数量

Mol Med Rep

125

Oncol Lett

43

Medicine (Baltimore)

12

Exp Ther Med

11

Mol Biol Rep

11

Pathol Res Pract

9

Pathol Oncol Res

7

Tumori

6

World J Surg Oncol

6

BioData Min

4

Comput Biol Chem

4

Eur J Med Res

4

Int J Clin Exp Med

4

J Comput Biol

4

其他40本杂志

65

大家尽量不要优先投前三,这三个杂志也是比较岌岌可危的情况。

①来自于希腊的Mol Med Rep,从2016年的数字来看,论文75%就来自中国大陆了,北京大学深圳医院(深圳市中心医院)一年就发表了超过66篇文章(不只是生信文章)在这上面,MMR一直坚挺到现在,也是服气的(是不是上面有人啊)。

②Oncol lett被国内很多单位评为负面期刊,甚至有些单位已经拉黑了,除此以外,一审太耗时间,要3个月以上,而且整的都是一些犄角旮旯里的不专业的审稿人,非常不专业,不赶时间的话,尽量改投其他的期刊。

③Medicine:接收量不算高,一年才10篇左右生信类文章,不过也被很多单位诟病了,慎投。

其他杂志可以瞄准了投一投。

(2)2~3分的生信SCI期刊

这个档次的文章可能是大家比较喜欢的档次了,分值马马虎虎,如果数据不足或者想着要急用的一些童鞋呢,最优先考虑的肯定是这个档次的,因为3分以上的其实是看运气的,有的时候质量可以也不一定能被认可呢,更别说赶时间了,师兄见过很多童鞋都是博士最后一年没办法了才开始做实验发文章,显然时间已经不是那么绰绰有余了。

可以看到,这个档次的文章虽然越来越多,但是增长的速度明显有一定限制的,毕竟还是需要一些真材实料的文章质量。

来看一看,排在前三的是:BMC Bioinformatics、PLoS One、Gene,其他一些杂志可以投一投,这三者不要优先投。

杂志

数量

BMC Bioinformatics

79

PLoS One

73

Gene

25

Oncol Rep

17

BMC Syst Biol

15

BMC Med Genomics

12

Biomed Res Int

11

Int J Mol Med

11

Mol Biosyst

9

PeerJ

7

Am J Transl Res

5

Cancer Biomark

5

Cancer Cell Int

5

FEBS Open Bio

5

Med Oncol

5

Arch Gynecol Obstet

4

Diagn Pathol

4

J Ovarian Res

4

Reprod Sci

4

其他48本杂志

63

(3)3~5分的生信SCI期刊

显然这个档次的文章已经不能随便灌水了,一般来讲,需要有一定程度的实验深度,生信分析之后的基因需要在组织样本、细胞中甚至是动物层面做一些验证实验,当然对分子机制的深入探讨要视前期的工作量了,通常有些童鞋为了急着毕业,把提前完成的工作或者本来可以发表到5分以上的文章改投这个档次的一些期刊,毕竟科研不能掐准时间说何时有好的结果,全凭自己对科研的理解程度以及合理安排实验的时间统筹了。

这个档次最喜欢这类文章的期刊前三包括:BMC Genomics、BMC Cancer、PLoS Comput Biol

杂志

数量

BMC Genomics

40

BMC Cancer

19

PLoS Comput Biol

18

Int J Oncol

13

Gynecol Oncol

11

Clin Epigenetics

7

Database (Oxford)

7

J Transl Med

7

Ann Surg Oncol

5

Hum Mutat

5

Int J Mol Sci

5

J Cell Biochem

5

J Proteome Res

5

Methods

5

Cancer Gene Ther

4

其他60本杂志

78

BMC GENOMICS 影响因子3.729,其中BMC的意思是BioMed Central系列期刊。

BioMed Central出版商每篇论文的版面费1-2万元,如果每种期刊每年发100篇论文,那么每年这个出版社收取的版面费数以亿计!2014年的大规模撤稿事件,有很多文章就来自于这家出版商。

商业利益的驱使必然导致一些漏洞存在,就像去年的TB事件一样,过犹不及,投稿的期刊要慎之又慎,而且自己的文章不要有造假的问题,灌水归灌水,但是造假就是学术不端了,否则后果就是毁灭性的。

生信类文章短平快的优点备受大家喜爱,望大家能学会这门技能,顺利达成所愿。

<think>好的,我需要帮助用户了解如何将Alzheimer的GWAS研究投稿到中科院二区的SCI期刊。首先,我要确定用户的需求是什么。他们可能已经完成了GWAS析,现在需要选择合适的期刊进行投稿,并且希望期刊属于中科院二区的范围。中科院二区的期刊在影响因子和学术影响力上属于中等偏上,所以需要推荐合适的期刊,同时给出投稿建议。 首先,我应该回忆一下常见的息学和遗传学领域的中科院二区期刊。例如,《Frontiers in Aging Neuroscience》可能是一个候选,因为它专注于衰老和神经退行性疾病,适合Alzheimer的研究。《Journal of Alzheimer's Disease》虽然更专业,但需要确认它是否属于二区。《Human Molecular Genetics》也可能符合,因为它涉及遗传学和疾病机制。另外,《PLOS ONE》虽然范围较广,但接受研究,且属于二区吗?需要核实区。 接下来,我需要确保推荐的期刊确实在最新的中科院区中属于二区。可能需要提醒用户自行确认,因为区每更新,可能会有变动。然后,要考虑每个期刊的特点,比如《Frontiers》系列可能有不同的子刊,用户需要选择最相关的。此外,投稿建议应包括研究创新性、数据质量、方法严谨性,以及补充实验的重要性,比如功能验证或多组学整合,以增加文章的竞争力。 还要注意用户的研究是纯息学析还是结合了实验数据。如果只有析,可能需要更强调方法的创新性和结果的物学意义。同时,推荐期刊时,应涵盖综合、神经科学、遗传学方法,以提供多样化的选择。例如,《Bioinformatics》和《Briefings in Bioinformatics》是否属于二区?可能需要确认,但通常它们可能在计算物学领域的高区。 此外,投稿时的格式要求和审稿周期也是需要考虑的因素。例如,《PLOS ONE》审稿较快,但版面费较高;而专业期刊可能审稿更严格但影响力更大。需要建议用户根据研究质量和时间安排选择合适的期刊。 最后,要确保回答结构清晰,点列出推荐期刊和投稿建议,并提醒用户注意期刊的最新区和投稿指南。同时,鼓励他们在投稿前进行充的数据验证和补充析,以提高接受率。</think>针对Alzheimer的GWAS研究投稿中科院二区SCI期刊的推荐及策略,以下为步解析: --- ### **一、推荐期刊清单(2023中科院区参考)** 以下期刊在神经科学、遗传学及息学领域具有影响力,且近收录GWAS和Alzheimer相关研究: 1. **《Frontiers in Aging Neuroscience》**(中科院二区,IF: 4.8) - **优势**:专注神经退行性疾病,接受析结合机制探讨的研究 - **适配方向**:GWAS新位点发现、遗传风险评、多组学整合析 2. **《Human Molecular Genetics》**(中科院二区,IF: 5.1) - **优势**:强调遗传学机制与疾病关联,偏好大样本GWAS+功能注释研究 - **适配方向**:新易感基因功能验证、通路富集析、跨种族验证 3. **《Journal of Neuroinflammation》**(中科院二区,IF: 9.3) - **优势**:关注神经炎症机制,适合GWAS与免疫微环境交互析 - **适配方向**:小胶质细胞相关基因筛选、炎症通路调控网络 4. **《Briefings in Bioinformatics》**(中科院二区,IF: 9.5) - **优势**:侧重息学方法创新,需提出新算法或工具 - **适配方向**:GWAS数据挖掘算法开发、多组学数据整合模型 5. **《Aging and Disease》**(中科院二区,IF: 7.0) - **优势**:涵盖衰老相关疾病机制,接受临床-结合研究 - **适配方向**:遗传风险与临床表型关联、药物靶点预测 --- ### **二、投稿策略与关键要点** #### **1. 研究创新性提升** - **数据层面**: - 使用多队列验证(如ADNI、UK Biobank) - 整合表观基因组(eQTL/mQTL)或单细胞数据辅助注释 - **方法层面**: - 开发新型遗传评模型(如PGS结合影像组学) - 应用因果推断方法(Mendelian Randomization) #### **2. 结果呈现优化** - **可视化要求**: - 曼哈顿图/QQ图需高清且标注显著位点(推荐使用$R$包`qqman`或`CMplot`) - 网络析图需包含核心调控基因(如使用Cytoscape) - **统计严谨性**: - 多重检验校正(如Bonferroni或FDR) - 人群层控制(PCA析需在方法中明确说明) #### **3. 功能验证建议** - **计算验证**: - 使用$DeepSEA$或$Enformer$预测非编码变异调控效应 - 通过$FUMA$进行组织特异性富集析 - **实验验证(可选但加)**: - 候选基因在AD细胞模型(如iPSC衍神经元)中敲除/过表达 - 利用斑马鱼或小鼠模型验证关键表型 --- ### **三、避坑指南** 1. **避免纯析**: - 单纯GWAS+富集析易被拒稿,需结合临床数据或实验验证 2. **注意数据权限**: - 公开数据库(如ADSP、IGAP)需明确引用数据来源 3. **审稿周期管理**: - 《Frontiers》系列平均3个月,《Human Molecular Genetics》约4-6个月 --- ### **四、期刊选择决策树** ```plaintext 研究型 → 纯方法创新? → 是 → 《Briefings in Bioinformatics》 ↓否 → 含实验验证? → 是 → 《Human Molecular Genetics》 ↓否 → 侧重临床关联? → 是 → 《Aging and Disease》 ↓否 → 聚焦神经炎症? → 是 → 《Journal of Neuroinflammation》 ↓否 → 保守选择 → 《Frontiers in Aging Neuroscience》 ``` --- **投稿前务必核实期刊最新区(可通过** [LetPub](https://www.letpub.com.cn/) **或** [中科院文献情报中心区表](http://www.fenqubiao.com/) **查询)**,并严格遵循目标期刊的格式要求(如GWAS报告需遵循STREGA声明)。
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