03 jni 编写

WGCNA样本量不够怎么办?5种替代方案帮你解决小样本基因共表达分析难题 本文针对WGCNA样本量不足的问题,提供了5种科学替代方案,包括CEMiTool、参数调整、多组学数据整合、机器学习特征提取和公共数据利用。这些方法帮助研究者在小样本条件下仍能进行可靠的基因共表达分析,特别适用于罕见病和珍贵临床样本研究。 阅读详情
  • 本地方法实现

可以由C或C++来实现。

 

C语言版本:

jdouble native_fun (

JNIEnv *env, /* interface pointer */ 通过vm环境的指针对java操作

jobject obj, /* "this" pointer */ 调用方法的对象

jint i, /* argument #1 */

jstring s) /* argument #2 */

{

/* Obtain a C-copy of the Java string */

const char *str = (*env)->GetStringUTFChars(env, s, 0);

...

/* Now we are done with str */

(*env)->ReleaseStringUTFChars(env, s, str);

return ...

}

C++语言版本:

extern "C" /* specify the C calling convention */

jdouble native_fun (

JNIEnv *env, /* interface pointer */

jobject obj, /* "this" pointer */

jint i, /* argument #1 */

jstring s) /* argument #2 */

{

const char *str = env->GetStringUTFChars(s, 0);

...

env->ReleaseStringUTFChars(s, str);

return ...

}

由上面两段代码对比可知,本地代码使用C++来实现更简洁。

 

第一个参数JNIEnv*env,它代表了VM里的环境,本地代码可以通过这个env指针对Java代码进行操作,例如:创建Java类对象,调用Java对象方法,获取Java对象属性等。

第二个参数jobject obj,相当于Java中的Object类型,它代表调用这个本地方法的对象,例如:如果有new NativeTest.CallNative(),CallNative()是本地方法,本地方法第二个参数是jobject表示的是NativeTest类的对象的本地引用。

 

如果本地方法声明为static类型

static jint native_get_count(JNIEnv* env, jobject thiz);

 

 

  • jclass类和如何取得jclass对象

在Java中,Class类型代表一个Java类编译的字节码,即:这个Java类,里面包含了这个类的所有信息。在JNI中,同样定义了这样一个类:jclass。了解反射的人都知道Class类是如何重要,可以通过反射获得java类的信息和访问里面的方法和成员变量。

 

(1)取得jclass对象

FindClass会在系统classpath环境变量下寻找name类,注意包的间隔使用 “/ “,而不是”. “

jclass cls_string=env->FindClass("java/lang/String");

(2)获得对象对应的jclass类型:

jclass GetObjectClass(jobject obj)

return functions->GetObjectClass(this,obj);

(3)获得一个类的父类jclass类型:

jclass GetSuperclass(jclass sub)

return functions->GetSuperclass(this,sub);

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