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原创 统计学中的矩(Moments)

正偏度表示分布右侧有较长的尾部,负偏度表示分布左侧有较长的尾部。解释:峰度反映了分布的形状特征,特别是分布的尖峰程度和尾部的厚度。解释:方差描述了数据点离均值的平均偏离程度,即数据的分散程度或波动性。定义:四阶矩通常是指峰度(Kurtosis),它衡量数据分布的尖峰程度和尾部厚度。定义:三阶矩通常是指偏度(Skewness),它衡量数据分布的对称性或偏斜程度。解释:均值是数据的“中心位置”或平衡点,它描述了随机变量的平均取值情况。定义:二阶矩通常是指关于均值的方差,它衡量数据的离散程度。

2025-01-11 02:40:01 829

原创 PET(正电子发射断层扫描)原理

正电子发射断层扫描(Positron Emission Tomography,PET)是一种功能性医学成像技术,利用放射性核素衰变产生的正电子和伽马射线来研究体内分子代谢和功能活动。

2024-12-06 03:50:18 643

原创 基于T1w.nii.gz文件生成可打印3D脑模型的步骤

所需的软件:FreeSurfer:用于脑组织分割和表面生成。本指南介绍如何基于T1w.nii.gz文件生成可打印的3D脑模型。必要的数据:T1加权MRI图像文件 (T1w.nii.gz)。图像空间配准所需的模板文件(原生图像空间的配准信息)。运行FreeSurfer的recon-all-clinical.sh脚本以处理T1加权MRI图像。步骤 1: 使用FreeSurfer的recon-all-clinical.sh。将生成的标签文件从.mgz格式转换为.nii.gz格式,便于后续处理。

2024-12-06 03:42:45 731

原创 MRtrix3预处理及DTI CSD-含代码

扩散加权成像 (DWI) 全流程预处理与分析。

2024-11-27 04:13:49 589

原创 MRtrix3预处理及DTI CSD-说明

代码实现了从 DWI 数据处理到高级纤维追踪的完整流程,包括去噪、伪影校正、配准、张量计算、球形解卷积、ROI 生成及纤维束追踪。它整合了 MRtrix 和 FreeSurfer 的功能,适用于高分辨率 DWI 数据的预处理和分析。使用 FreeSurfer 对 T1 图像进行分割,生成灰质、白质和 CSF 的五组织类型(5tt)。提取校正后的 b0 图像,与 T1 图像对齐,生成转换矩阵并应用配准。基于 AP 扩散数据生成初始掩膜,并膨胀3次,以捕获更多区域。校正运动与畸变,同时处理正反向相位编码。

2024-11-27 03:57:37 491

原创 MRtrix3 预处理流程

@[TO扩散加权成像 (DWI) 预处理流程确保进入指定的 DWI 数据目录。如果失败,则退出程序:数据转换将 NIfTI 格式的扩散图像转换为 MRtrix 的 格式:掩膜生成基于 AP 相位编码数据生成预处理掩膜:去噪使用 对扩散图像进行去噪,并生成噪声水平:校正 Gibbs 环伪影通过 修正 Gibbs 环伪影:运动与畸变校正提取 b0 图像(正向和反向相位编码)并拼接为成对图像:使用 进行运动与畸变校正:偏置场校正使用 ANTs 方法校正偏置

2024-11-27 03:37:33 1007

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