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原创 Endnote插入中文文献中将“et al”替换为“等”的方法

本文介绍Endnote插入中文文献中将“et al”替换为“等”的具体操作步骤。

2025-03-03 23:17:20 5454 12

原创 lmp2arc将LAMMPS生成的轨迹文件转为Materials Studio (MS)可读取的轨迹文件

本文将介绍具体的操作步骤。其中,../bin/lmp2arc.exe为第三步生成的可执行文件,如果在第三步中没有把lmp2arc.exe放入bin中,而是保留在src目录中了,则调用命令为:../src/lmp2arc.exe。-car后的CH4.car文件为第三步拷贝进来的.car文件,后面的CH4.arc文件是拟生成的可用来导入MS的轨迹文件,名字可以随便取,但是后缀要用.arc,否则MS读不出来。这里举例用的轨迹文件和.car文件分别是CH4.arc和CH4.lammpstrj,如下图所示。

2024-11-18 22:23:53 2220 3

原创 insight2lammps将MS导出的结构文件转成LAMMPS的data文件

Material studio 导出的结构文件,通过insight2lammps.pl的脚本,转成LAMMPS可读取的data文件

2024-06-16 23:45:11 2773 4

原创 向日葵连接服务器连接失败解决

修改DNS的步骤:电脑本地连接右键属性——能看到一个Internet协议版本 4(TCP/IPV4)或者Internet协议版本 (TCP/IP)——双击进去之后的界面的下面有DNS——把首选改成119.29.29.29 备选为223.5.5.5——修改好之后直接确定就可以(修改之前如果你的DNS 是自己手动设置,(建议你先记住你自己的DNS在进行修改,如果修改DNS之后电脑不能上网就把DNS改回您原来的DNS)。检查了一下,确实是时区设置错了,修改后就好了,可以连接了。咨询了向日葵客服,给了如下回复。

2024-06-07 19:32:16 32332 2

原创 VMD导入GRMOCAS生成的轨迹文件

gromacs轨迹文件导入VMD详细步骤

2024-06-05 22:58:12 6039 2

原创 蒙特卡洛模拟软件Towhee的安装及使用

本文分享蒙特卡洛模拟软件towhee的安装和运行方式。

2023-09-06 00:10:05 2213 6

原创 在Ubuntu中安装Palabos

介绍在win10的子系统Ubuntu中安装palabos的过程。

2022-11-30 11:59:20 1780

原创 ipad上的ish配置ssh

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2022-11-10 01:49:49 5884 1

原创 LAMMPS中setforce命令使用

使用setforce命令实现固定时,需要利用velocity命令将原子集团的初速度设为0。

2022-09-25 21:06:48 2051 1

原创 MS建模后转成LAMMPS的data文件

介绍利用Materials Studio建模,并转换成lammps所用的力场文件的方法。

2022-09-19 00:13:24 24657 25

原创 Windows系统中安装子系统Ubuntu

在windows中安装子系统ubuntu,并进行文件传输。

2022-09-18 10:33:06 4638

原创 WHAM数据处理(Grossfield lab)

介绍在ubuntu中配置Grossfield Lab发布的伞状抽样(WHAM)软件,以及环境变量配置方法。

2022-09-18 10:11:23 2461 7

原创 Palabos—在自定义文件夹中创建文件并运行

初学palabos,记录下来方便自己以后查阅

2021-12-30 07:03:05 625

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