细胞内粒子识别与统计作图

最新推荐文章于 2024-10-24 15:12:52 发布

原创

最新推荐文章于 2024-10-24 15:12:52 发布 · 781 阅读

2 ·

CC 4.0 BY-SA版权

文章标签：

#粒子识别 #统计作图 #ImageJ

本文探讨了在暗场细胞图像中，面对具有高背景的纳米颗粒，如何进行有效的粒子识别和统计分析。通过使用ImageJ工具，实现了自动识别不同颜色的粒子并进行标记，为后续研究提供了便利。

问题

贵金属纳米颗粒如纳米金和纳米银

在暗场显微镜下

具有特定颜色的散射光斑

其颜色类型与纳米颗粒的大小，形貌以及聚集状态相关

现在获得了大量暗场细胞图像

细胞存在较高的背景

如何从这样的图像中对粒子进行统计分析

代码实现

因为时间关系，直接上代码，以后再细讲

/*
 * count particles automatically
 */
 
 //global parameters------
 hue_blue = 300;
 hue_green = 160;
 hue_yellow = 65;
 dot_k = 10;
 p_noise = 20;
 
 //functions------

 function mark(){
 	type = newArray("monomer","dimer","polymer");
 	Dialog.create("mark it!");
 	for(i=0;i<lengthOf(type);i++){
 		Dialog.addNumber(type[i], 0);
 	}
 	Dialog.setLocation(900,200);
 	Dialog.show();
 	res = newArray(lengthOf(type));
 	for(i=0;i<lengthOf(type);i++){
 		res[i] = Dialog.getNumber();
 	} 	
 	return res;
 }

 function drawmap(map,title,width,height){
 	n = sqrt(lengthOf(map));
 	newImage(title,"RGB black",w