Sentieon 2025.2 最新 支持集群 linux

 Sentieon软件的使用非常灵活。用户可以直接使用完整Pipeline流程，也可以根据需要单独调用相关模块去替换原流程中的模块。Sentieon模块的输入、输出文件严格按照生信行业规范进行操作，用户可轻松上手，大大降低学习难度和学习时间。

主要模块的应用流程
      Sentieon软件为从BWA、GATK、MuTect、MuTect2、Picard切换到Sentieon运行环境的用户，提供了完善的无缝的脚本和示例供用户使用，可参考本页面内的资料下载栏目，下载想要文档进行学习参考。同时为用户方便进行在线学习，我们提供了完善的帮助系统：  

Sentieon软件为完整的纯软件基因变异检测二级分析方案，其分析流程完全忠于BWA、GATK、MuTect2、STAR、Minimap2、Fgbio、picard等金标准的数学模型。在匹配开源流程分析结果的前提下，大幅提升WGS、WES、Panel、UMI、ctDNA、RNA等测序数据的分析效率和检出精度，并匹配目前全部第二代、三代测序平台，对短读长NGS、长读长longread测序数据进行SNP/INDEL/SV分析。最高支持20万人全基因组联合变异检测分析。

Sentieon为纯CPU计算加速软件，完全适配主流CPU计算架构：Intel、AMD、海光等X86架构CPU，华为鲲鹏、阿里倚天等ARM架构CPU。可灵活部署在实验室单机工作站、HPC集群、超算中心和云计算中心，保持同一套流程下不同规模数据计算结果的一致性。

Sentieon软件团队拥有丰富的软件开发及算法优化工程经验，致力于解决生物数据分析中的速度与准确度瓶颈，为来自于分子诊断、药物研发、临床医疗、人群队列、动植物等多个领域的合作伙伴提供高效精准的软件解决方案，共同推动基因技术的发展。 截至2023年底，Sentieon已经在全球范围内为1300+用户提供服务，被世界一级影响因子刊物如NEJM、Cell、Nature等广泛引用，引用次数近千篇。此外，Sentieon连续数年摘得了Precision FDA、Dream Challenges等多个权威评比的桂冠，在业内获得广泛认可。

软件兼容性
      在基因计算领域，因为GATK是针对x86指令集开发的，使用没有针对ARM专门优化的GATK将比在x86处理器上要缓慢很多，基因行业很难享受到ARM处理器的低成本优势。因此，我们对Sentieon软件的所有模块针对ARM指令集进行了全面的优化和评测，于2019年11月底推出Sentieon Genomics for ARM软件包，全面支持基于ARMv8架构的处理器，包括AWS Graviton、华为鲲鹏920、AMPERE Altra和阿里云的ARM方案。在保证结果和x86处理器一致的前提下，将已经降低了的基因计算的成本再次降低30%或以上。至此，Sentieon全面兼容从云、超算中心、本地服务器的X86和ARM架构计算。 

Sentieon软件已被1200多家商业公司和科研机构使用，得到广泛认可。到2022年8月为止，Sentieon软件已经运行处理的数据量超过2700PB，样本量达数百万，时长超过4亿7千万核时。截止2022年第三季度，在包括NEJM、Cell、Nature等世界一级影响因子的刊物上被引用次数多达650篇。
部署在集群上，是有多台计算节点。使用argo workflow工作流，在这个工作流中是要使用这个软件的docker镜像。

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