数据下载方式

stayn1ght

于 2021-03-19 12:21:06 发布

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分类专栏：数据下载分析

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prefetch --option-file SRR_Acc_List.txt
fastq-dump -o $HOME/data_download --gzip ~/ncbi/pubilic/sra/*.sra

## 将生成.fastq格式的文件
fastq-dump --split-3 *.sra
## 使用split-3,是为了提取双端测序文件,否则会出错

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