ggoplot2绘制 柱状图

该博客展示了如何使用R语言的ggplot2库来绘制多个样本的相对丰度分布图,并通过 facet_grid 进行多图展示。同时,定义了颜色方案并保存了图像文件。代码涉及数据读取、整理、柱状图绘制以及图形的自定义设置。

摘要生成于 C知道 ,由 DeepSeek-R1 满血版支持, 前往体验 >

# Title     : TODO
# Objective : TODO
# Created by: Administrator
# Created on: 2021/1/30
#导入包
library('tidyverse')
library('reshape2')
#定义向量
l <-c('Phylum','Order','Genus','Species')
h <- 'f://'
#定义函数
f<-function (h,m){
  data <-readxl::read_xlsx(paste("F://",m,".xlsx",sep=''))#,sheet = 'Sheet2') #读取excel
  b <- melt(data,variable.name ='Taxa') #把数据整理为 ggplot2能读取的格式
  c <- b[[m]]
  fil <-c('#FF0000','#008B00','#FFD700','#9400D3','#00BFFF','#C1CDCD','#66CDAA','#000080','#DB7093','#C6E2FF',
        '#EEEE00','#9FB6CD','#00FF7F','#4682B4','#912CEE','#EEE5DE','#FFDAB9','#96CDCD','#9AFF9A','#FF8C69','#EEE8AA','#1C1C1C')#定义颜色
  # stat数据随y,柱宽,width,cok柱边框颜色。position 柱状填充方式。
  ggplot(b) +
    geom_bar( mapping = aes(x = c, y=value, fill=Taxa,color=fil)
      ,stat = "identity", width=0.87, col='black',position='fill')+
      facet_grid(.~ID,scales='free',space='free')+
      theme_bw() +
      theme(axis.text.x = element_text(face = "bold", vjust = 0.5, hjust = 0.5,angle = 45),text=element_text("serif"),legend.position = 'none') +
      scale_fill_manual(values= fil)+
      xlab(m)+
      ylab('Relative abundance')
      guides(fill = guide_legend(ncol=1))
  ggsave(filename = paste(h,m,'.png',sep='') , height=8, width=8, units = 'in', dpi=300)
}
for (m in l){
  f (h,m)
  print(m)
}

其中一个图

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