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原创 系统发育树的美化之注释文件的使用(iTOL)
,按照以下步骤进行下载注释文件模板Help→Help pages→Tree annotation→Annotation templates→example_data.zip.#在上一篇中,有提到注释文件美化进化树,但没有做详细的讲解,有朋友问到,这次来讲一下模板的下载及如何使用。因为文本编辑不是很方便,可以更改后缀.txt为.xls,用Excel打开进行编辑。模板较多,官网上都有详细讲解,我这里就讲解一下如何给ID上色,这个用得比较多。先介绍这么多了,欢迎评论区展示你的成果!2.模板的格式与使用。
2024-11-05 17:06:37
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原创 系统发育树的生成与美化(MEGA7和iTOL)--1.MEGA7生成系统发育树
生成系统发育树,在这里选择的是最近邻居法,点击Phylogeny→Construct /Test neighbor-joining tree。选择Data→Export alignment→MEGA Format。1.序列准备-本文中的数据LOC号是在文献中的附件中所找到的,然后在。序列查找完成后先保存为txt格式,重命名更改为fasta格式;>后面的注释是该序列的名称,可以根据需求更改。iTOL的使用下次再写哈,欢迎在评论区讨论。选择默认设置,点击OK生成比对文件。方便之后导入iTOL进行美化。
2023-06-07 17:56:26
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空空如也
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