【踩坑】MPI多机配置与NPB的安装、使用

最新推荐文章于 2024-08-14 20:02:45 发布

叫我H2就好了~

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文章标签： linux 服务器运维 ssh

本文链接：https://blog.youkuaiyun.com/qq_44861598/article/details/126915241

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本文详细介绍了MPI多机配置步骤，包括环境变量设置、用户名统一、NFS文件系统配置、hosts文件更新等内容，并提供了SSH免密通信的学习参考资料，以及NPB基准测试的安装配置指南。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

MPI多机配置

多机配置步骤

配置mpi运行环境，添加环境变量
设置用户（用户名统一）
布置nfs文件系统，并导出指定目录 /home/antl/cloud
配置hosts文件，添加 client(加入的主机)，master(当前的主机)主机地址；确保ssh client 可以顺利登陆
配置当前master主机别名到client /etc/hosts 文件中
把可执行文件拷贝到nfs导出目录：/home/antl/cloud之中
在master节点nfs共享文件夹中运行程序：mpirun -n 10 -hosts client,master ./mpi_hello_world

建议参考文档

配置如何多机运行 Running an MPI Cluster within a LAN · MPI Tutorial

注意：

STEP 2 : 若用户名已经相同可以跳过 ☺️

STEP 3 : 建议在此处参考下面的ssh免密通信学习参考文章，使用rsa密钥类型

STEP 4 : 使用NPB貌似不需要可执行文件在cloud目录下
cat /etc/exports
/home/mpiuser/cloud *(rw,sync,no_root_squash,no_subtree_check)
其中nfs文件配置参数可参考nfs的配置文件/etc/exports - houyongchong - 博客园 (cnblogs.com)
挂载出现问题时注意文件路径😭

STEP 5 : 多机运行时，放在共享文件夹（如cloud）的代码不需要每个机器单独编译；但是如果使用NPB，需要在相同路径下每个机器分别编译生成可执行文件

ssh免密通信学习参考 Linux - 配置SSH免密通信 - “ssh-keygen”的基本用法 - 瘦风 - 博客园 (cnblogs.com)

注意：

需要使 ssh root@manger 可以直接免密通信。例：修改worker3的host文件
$ cat /etc/hosts
127.0.0.1	localhost
#127.0.1.1	1947

#MPI CLUSTER SETUP
172.50.88.22	manager
172.50.88.54	worker3
hosts文件的格式如下：

IP地址主机名/域名；可参考文章 Linux hosts文件详解及配置_yujkss的博客-优快云博客_linux配置hosts

NPB学习参考 NPB benchmark（NAS Parallel Benchmarks）使用、安装和配置_dadan9的博客-优快云博客_npb测试

注意:

文章中 mpirun -np 8 is.B.8 应改为 mpirun -np 8 ./is.B.8
NPB的安装目录需一样，其中make出现问题多办为编译环境问题，😭 可参考阿里云服务器下NPB的安装与测试 - Lzxgg - 博客园 (cnblogs.com) 中的mpi配置。如果还是make报错，可尝试重新cp make.def.template make.def 不配置，直接编译试试。
建议尝试IS编译后，尝试其他内核的编译效果。其中IS为C语言编写，其他为fortan
参考同篇作者，mpi与NPB整合，有结果在ubuntu 18上进行NPB和mpiP的整合_dadan9的博客-优快云博客