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原创 ITK对医学影像进行reorientation

由于sitk转为numpy会改变各维度顺序,因此在部署时相应改变方向,此处为IAR。在C++部署中,同样使用itk中的相关滤波进行相同操作。

2023-12-11 11:49:58 524 1

原创 L2R OASIS数据集脑区标签

下图为由ITK-SNAP可视化的脑区标签示例:在该数据集中将脑区分为35个区域,通过与FreeSurfer/SAMSEG处理结果对比得到对应类别如下:0 bg1 左侧脑白质2 左侧脑皮质3 左侧侧脑室4 左侧下侧脑室5 左侧小脑白质6 左侧小脑皮质7 左侧丘脑8 左侧尾状核9 左侧壳核10 左侧苍白球11 第三脑室12 第四脑室13 脑干14 左侧海马15 左侧杏仁核16 左侧伏隔区17 左侧腹腔18 左侧血管。

2023-11-23 13:30:53 578 1

原创 ITK对图像进行重采样

【代码】ITK对图像进行重采样。

2023-10-25 17:31:21 205 1

原创 ITK对图像进行归一化预处理

三种方案:1.可遍历图像统计均值与方差。2.使用StatisticsImageFilter统计均值方差。3.直接使用NormalizeImageFilter进行归一化。以下给出2、 3两种方案代码。

2023-10-25 09:56:38 181 1

原创 ITK进行形态学闭运算与连通域大小筛选

【代码】ITK进行形态学闭运算与连通域大小筛选。

2023-06-19 15:52:58 193

原创 pip install报错 invalid floating-point value

在此处,xxx为对应需要删除的语句,我的命令为install.timeout。如下图所示,在pip install过程中突发错误。但在global对应路径下没找到pip.ini文件,无论pip install 什么都会报一样的错。pip install不再报错!得到以下结果,红框即为需要删除的部分。通过以上命令发现确实不存在。查看pip config。

2023-05-31 16:51:08 680 1

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