ModuleNotFoundError: No module named'‘gromacs'下载安装python第三方模块gromacs

本文介绍如何解决在Jupyter Notebook中导入Gromacs包时遇到的ModuleNotFoundError错误。通过使用GromacsWrapper,可以轻松地在Python环境中调用Gromacs工具,避免复杂的安装过程。文章提供了通过brew和pip安装Gromacs及GromacsWrapper的方法。

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使用jupyter notebook导包

报错:ModuleNotFoundError: No module named 'gromacs'表示需要导入python第三方包gromacs,网上找了很多办法,但是很麻烦又需要安装cmake,fftw等。写下这篇博客记录一下自己抓狂?的心情。

GromacsWrapper

后来发现了一个神奇的东西GromacsWrapper,它是一个调用Gromacs工具的封装Python包,其能够完美的通过python脚本来运行gromacs工具。直接在命令行下载gromacs后,在下载GromacsWrapper,就能使用GromacsWrapper自动去调用运行gromacs,就OK了!!

使用brew下载:

brew install gromacs
brew install GromacsWrapper

使用python带的pip下载:

pip install gromacs
pip install GromacsWrapper

对我自己mac系统的话,一直是首先考虑brew下载,很多pip不能下载的包,brew也能下载,but它很不好的地方就是,有些包在下载的时候总显示gcc不兼容情况,如果出现pip和brew都不能下载的包就本地下载包。

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