使用jupyter notebook导包
报错:ModuleNotFoundError: No module named 'gromacs'
表示需要导入python第三方包gromacs
,网上找了很多办法,但是很麻烦又需要安装cmake,fftw等。写下这篇博客记录一下自己抓狂?的心情。
GromacsWrapper
后来发现了一个神奇的东西GromacsWrapper,它是一个调用Gromacs工具的封装Python包,其能够完美的通过python脚本来运行gromacs工具。直接在命令行下载gromacs后,在下载GromacsWrapper,就能使用GromacsWrapper自动去调用运行gromacs,就OK了!!
使用brew下载:
brew install gromacs
brew install GromacsWrapper
使用python带的pip下载:
pip install gromacs
pip install GromacsWrapper
对我自己mac系统的话,一直是首先考虑brew下载,很多pip不能下载的包,brew也能下载,but它很不好的地方就是,有些包在下载的时候总显示gcc不兼容情况,如果出现pip和brew都不能下载的包就本地下载包。