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linux常用命令 基本命令 ls 查看路径下的文件 echo 输出输入的东西/类似于print ps 查看进程信息/一般查进程PID的时候用 top 动态查看进程信息/动态看进程占用的资源大小 > 重定向：cat aa.txt > bb.txt 将aa.txt内容复制到bb.txt >> 追加重定向：cat aa.txt >> bb.txt 将aa.txt内容追加到bb.txt du 查看当前文件大小 df 查看磁盘使用情况 kil.
2020-10-21 19:59:39
160
原创 c++
C++ 指针 指针：（4字节 32位，8字节64位） 不能取访问的指针： 空指针：初始化为0，不可直接访问，（0~255无法放问） 野指针：指向非法的的地址块（无访问权限）。 const 修饰指针(const int * p)：常量指针(指针的指向可以修改，但是指针指向的值不能改) 修饰常量（int * const p）：指针常量(指针的指向不能修改，但是指针指向的值能改) 修饰常量又修饰常量(const int * const p)：都无法修改 指针访问数组： int arr[10]; int * p
2020-06-08 19:25:09
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原创 国家微生物科学数据中心精品公开课---笔记
人体微生物组与健康—朱宝利 背景 微生物无处不在 微生物组：以群体形式发挥作用 人体基因组决定了人体健康基础，微生物组决定了人体健康状态。 人体微生物组计划—精准医学—精准医疗 DNA（变异、遗传病相关，药物治疗）、临床、基因组，表观基因组，蛋白质大数据 概念： 微生物组：任意一个生态环境中的微生物群及其基因组的总和，包括相互作用（微生物群+基因组+相互作用） 微生态：任意一个环境中的微生物总和及状态（宿主+微生物群落） 元基因组：也称宏基因组，指任意一个生态环境中的微.
2020-05-26 20:46:17
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原创 设计模式，稳定中有变化的情况
变化与稳定的分割 构造函数调用虚函数是静态绑定 别人的笔记 面向接口编程：设计为抽象基类 对象创建： 6、工厂方法 通过继承基类来对多个相似的具体类进行构造，从而可以动态绑定所使用的类。绕开new具体类，避免依赖具体实现细节，将类的选择放到未来传入所在函数再new对象（将基类与具体类分开写在不同文件夹）。 7、抽象工厂（由上面增加） 不同：一系列互相依赖的对象创建（将有关系的类合...
2020-03-27 11:10:38
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原创 我的记录
有用的网站 1、github 2、w3school 可以在线运行一些程序 3、letcode 一、linux环境部分 1、linux下无法编译出双击可执行文件： 自16.10起，gcc就默认开启了pie选项，导致编译出的文件的mime是application/x-sharedlib，一般的文件管理器只认application/x-executable，就没把它当成可执行的。https://f...
2020-02-11 15:17:32
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原创 论文阅读：蛋白质作用预测
一、deepNF ： 1、目的：预测蛋白质功能 2、方法：多模型的深度自编码器，从多种异构相互作用网络中提取高级特征，使用random walk with restarts(可以回到原点的随机游走) 与 positive pointwise mutual information将network转化为vector，输入到自编码器中学习其低维表示最后使用svm来进行分类。（对比算法mashup与g...
2019-12-09 22:17:03
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原创 论文阅读：Finding Archetypal Spaces for Data Using Neural Networks
Finding Archetypal Spaces for Data Using Neural Networks： 1、目的：使用神经网络寻找数据的原型空间（寻找它的顶点后用多面体拟合数据） 2、方法：使用神经网络学习数据，降维表示后再进行拟合。AAnet：自编码器，数据空间转换。 2.1、实验数据集：非线性合成数据，两个生物数据集dataset of gut microbiome prof...
2019-12-09 10:55:16
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原创 论文阅读：DeepCORAL
DeepCORAL：https://github.com/VisionLearningGroup/CORAL. 1、目标：提出一种域自适应（在无标签的情况下完成另外一个域的训练分类。） 2、方法：使用预训练好的模型，对相似数据的其他域进行在训练，从而达到分类的效果。 3、亮点：定义了一个不同域的loss函数，可以另外加于某一层，加权后于分类loss一起使用。 ...
2019-12-09 10:27:15
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原创 Refseq : accession id to taxonomy lineage.
本文介绍的是关于Refseq生物基因组数据库库，如何从物种的accesionid 转化到具体的 taxonomylineage的方法： 下载Refseq的完整基因组数据 我们可以通过ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/release/complete/来下载完整的基因组数据，从 assembly_summary_refseq.txt获取ta...
2018-11-12 21:27:02
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原创 初始化方法的比较
import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt import sklearn import sklearn.datasets from init_utils import sigmoid, relu, compute_loss, forward_propagation, backward_propagation from init_utils i
2017-11-12 14:28:03
158
空空如也
空空如也
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