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RSS订阅转载 os.path.join
os.path.join()函数：连接两个或更多的路径名组件 1.如果各组件名首字母不包含’/’，则函数会自动加上 2.如果有一个组件是一个绝对路径，则在它之前的所有组件均会被舍弃 3.如果最后一个组件为空，则生成的路径以一个’/’分隔符结尾 Demo1 import os Path1 = 'home...
2019-11-05 09:28:41
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原创 pandas常见操作
条件A，B data[(data[A])&(data[B])] 取均值 pd.mean() 取分位数 pd.percentile() 连接 pd.concat([a,b],axis=1)#列concat #连接之前可 A=a.reset_index(drop=True) 查找 pd.merge(a,b)#需要列名一致 ...
2019-10-28 23:53:51
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原创 domain查找及去冗余
domain查找命令 hmmscan --cut_ga --tblout 50Aresult1 Pfam-A.hmm 50S.fasta blast blastp -query test3_1 -subject test3_2 -outfmt 6 -evalue 1e-5 -num_descriptions 10 -num_threads 8
2019-10-24 17:53:45
296
原创 用awk将换行的fasta转换为连续的序列
awk '!/^>/{a=a$0}/^>/{print a;a="";}END{print a;}' inv_protein.fasta > test_inv
2019-10-24 10:14:20
628
转载 pandas加载出错UnicodeDecodeError
加载文件指令： test=pd.read_csv(r'F:\book_list_1.csv',sep=',',names=['book_id','book_name','author'],skiprows=1) 出现的错误： UnicodeDecodeError: 'utf-8' codec can't decode byte 0xb5 in position 0: invalid st...
2019-10-24 10:09:40
842
空空如也
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