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原创 【NMR数据处理】用Python3驱动Topspin5.0.0,吃螃蟹记录

写了python3驱动Topspin的方式

2026-05-14 21:17:39 101

原创 【脑MRI组学】BASE OASIS-1数据集做分割任务预处理时候的一个踩了的小坑,随手记录一笔

我的任务是颅骨剥离,那数据集就是带颅骨的,标签就是不带的,标签那么大一圈颅骨没了,你觉得少圈颅骨尺寸能一样吗?注意,原始数据和标签的所处空间不一致,一定要立马拿去和MNI152 1mm模板配准了。标签:每个被试者的FSL_SEG文件里头包含的,基于FSL BET剥过颅骨的,配准到MNI152 1mm模板的4值标签,0是空气,1是脑脊液,2是灰质,3是白质。开篇放问题:训练颅骨剥离模型,明明尺寸几乎都成比例了,就差那么一圈,仿射矩阵就差那么一点,这数据和标签死活配不准,啥算法都不准,一配就出大问题。

2025-11-24 21:34:28 374

原创 Linux下基于getfsl.sh去安装fsl过程记录

Linux - Install - 直接看他的第2步,不要执行他的命令,直接下载getfsl.sh。Linux 右键打开一个终端,我会习惯性地把脚本从中文路径中挪出来(你随意)fsl换新页面后,目前没有用新脚本安的攻略,所以现在写攻略。输入英文的符号“:”(命令操作模式->打开命令行)“(w:保存,q:退出,!输入小写的i(命令操作模式->文本输入模式)按下esc(文本输入模式->命令操作模式),有就自行处理一下,毕竟我没有;,没有就自行处理一下,反正我有。如果有,看看你的shell类型。

2025-08-05 11:44:43 627

原创 Ubuntu 24.04下给python换国内的pip源(下载速度飞快,解决 ReadTimeoutError (self._pool, None, “Read timed out.“)!)

如果你的项目不生效,还存在一种可能性,那就是你之前尝试过修改你项目所在虚拟环境的源。如果你虚拟环境改过了,仅在那个环境下是会覆盖全局的。不知道pip源在哪?先尝试写个中科大的源进去再说。用vim打开它,再多塞几个源进去。(注:chalk是用户名,我叫chalk)不同源之间是用空格分割的。你看电脑这不就告诉你了?

2025-04-22 22:20:02 578

原创 Ubuntu 24.04 给APT换国内源

Ubuntu 24.04下,APT源的格式相较之前有变动,之前的经验是不可用的。如需改动,只需改URIS那行,其他完全不需要动。

2025-04-22 22:08:20 5037 2

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