vHTS注意事项

运行生成js文件的命令与前面的数据库和flag.txt以及xml无关

unbuntu@unbuntu-virtual-machine:~/ligand_docking/2_vHTS$ python2.7 /home/unbuntu/rosetta_src_2019.35.60890_bundle/tools/hts_tools/make_evenly_grouped_jobs.py ligand_files/params/ protein_files/ --n_chunks 1 --max_per_job 1000 --inactive_cross_dock job

（1）2_vHTS/protein_files/目录下的蛋白质文件需要以1KV2开头
（2）2_vHTS/ligand_files/params/目录下的文件按教程二的命名格式文件夹：0a、0f…；
（2-1）conformers文件标红的内容全部换成与命名一致的00C 以及全部为X

（2-2）params文件底部添加一下内容

STRING_PROPERTY system_name 1KV2_cleaned_0002.pdb
NUMERIC_PROPERTY log_ki 1.000000
STRING_PROPERTY ligand_id BindingDB_14835

（2-3）pdb文件全部替换成（文件名 X）