【代码更新】单细胞分析实录(21): 非负矩阵分解(NMF)的R代码实现，只需两步，啥图都有

1. 起因

之前的代码(单细胞分析实录(17): 非负矩阵分解(NMF)代码演示)没有涉及到python语法，只有4个python命令行，就跟Linux下面的ls grep一样的。然鹅，有几个小伙伴不会命令行，所以我决定再改写一下，把命令行都放到R下面运行。

2. 尝试

2.1 一开始，我的想法是教大家在R里面调用python，需要提前下载好anaconda和一些python包 然而想了想在Windows上安装python包可能对大家不是很友好，有些包很难装，我之前也弄了很久。考虑到这次更新是针对桌面版Rstudio用户，故没有采用。

2.2 最终，我采用的方案是，使用Rstudio Server，也就是网页版Rstudio 这样做有几个好处：

• 直接和云服务器连接，服务器下载python包和R包都很容易（云服务器刚买，下血本）
• 我提前配置好运行环境，用户只需上传数据，分析数据，下载数据即可。

代码方面也更加简化：

• 我尽量减少了人工处理的时间，主要分析代码只有两行

如果你之前在我这儿拿过代码，可以直接找我要更新的代码。此外，如果因为之前的代码涉及命令行，你操作起来有困难，可以找我开Rstudio Server的账户 (高端玩家就别了，服务器配置比较低，就够几个人用的那种)。