AIMD_Toolkit详细教程：MATLAB中分子动力学轨迹分析与VASP轨迹读取及核密度的VESTA可视化

一、简介

随着分子动力学模拟在物理、化学和材料科学中的日益广泛应用，处理和分析模拟产生的大量数据成为了一个关键步骤。为此，AIMD_Toolkit应运而生，为科研工作者提供了一个强大而便捷的MATLAB工具包，能够从VASP输出文件中提取轨迹，并以VESTA可读的格式展现核密度。本文将详细介绍如何使用AIMD_Toolkit进行相关操作。

二、安装与配置AIMD_Toolkit

首先，您需要在官方存储库中下载AIMD_Toolkit的最新版本，并将其添加到MATLAB的路径中。

步骤1: 克隆或下载AIMD_Toolkit仓库

git clone [AIMD_Toolkit的仓库地址]

步骤2: 在MATLAB中，导航到AIMD_Toolkit的目录，并添加路径：

addpath(