
Chemistry Development Kit
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Chemistry Development Kit
程序员诚哥
开源项目ruoyi-wms、ruoyi-mall、ruoyi-fast-service作者
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Chemistry Development Kit (CDK)原子类型、描述、分子式和子结构搜索
CDK(Chemistry Development Kit)是一个开源的Java化学信息学工具包,提供了分子的计算机表示和分子信息学操作的方法,包括分子的描述、图形化的分子编辑、分子数据库查询、分子特征描述符生成、分子结构搜索、化学反应预测和化学图像生成等功能。原创 2023-02-24 15:08:16 · 1360 阅读 · 0 评论 -
JS分子结构编辑器:基于SMILES来绘制分子结构,类似于Marvin JS
如果想显示化学结构式, 是不是也有相应的Javascript库可用呢?最近开源了一套VUE编写的化学分子编辑器、化学结构编辑器DEMO,集成了JSME,ketcher。支持在台式电脑以及iPhone、iPad和Android智能手机和平板电脑等手持设备上绘制和编辑分子和反应。https://gitee.com/zccbbg/vue_molecule_editor原创 2022-12-06 10:44:37 · 1666 阅读 · 0 评论 -
使用Chemistry Development Kit (CDK) 来进行化学SMILES子结构匹配
SMILES是一种用于描述化合物结构的字符串表示法,其中子结构搜索是在大规模化合物数据库中查找特定的结构。然而,这种搜索方法存在一个误解,即将化合物的子结构视为一个独立的实体进行搜索,而忽略了它们在更大的化合物中的上下文。我们使用Chemistry Development Kit (CDK)进行搜索。这种方法可以避免由于上下文缺失而导致的搜索结果不准确的问题。上图为我们开发的一个编辑器,用于方便查询。原创 2023-02-24 13:24:15 · 1511 阅读 · 0 评论