生物信息-linux-centos8-安装blast

参考:
安装blast
https://blog.youkuaiyun.com/flyfrommath/article/details/52945586

error while loading shared libraries: libnsl.so.1: cannot open shared object file: No such_libnsl.so.1 cannot open-优快云博客
https://blog.youkuaiyun.com/qq_42629988/article/details/121180464


首先找到ncbi的ftp,找到需要的版本。这里我选的是可执行文件,因为不想手动编译了。

https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+

我这里想安装2.7.1,所以找到适合的版本,复制链接
在这里插入图片描述
在服务器指定路径下进行下载:

wget https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/2.7.1/ncbi-blast-2.7.1+-x64-linux.tar.gz

解压缩:

tar -zxvf ncbi-blast-2.7.1+-x64-linux.tar.gz

解压后进入blast目录,找到bin文件夹,这里放了相关的可执行文件,所以需要把这个路径加入~/.bashrc,然后source一下生效:

export PATH=/xxxx/blast/bin:$PATH

此时执行blastn,发现报错:

blastn: error while loading shared libraries: libnsl.so.1: cannot open shared object file: No such file or directory

首先,需要检查系统中是否已安装libnsl:

sudo find / -name libnsl

如果有的话,修改软链接即可。如果没有,则需要手动安装:

yum install libnsl

安装完毕后,检查:

[root@localhost ~]# blastn -version
blastn: 2.7.1+
 Package: blast 2.7.1, build Oct 18 2017 19:57:24
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